PML蛋白组织异染色质结构域并调控ATRX/DAXX介导的组蛋白H3.3沉积

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66364

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

染色质稳态的维持涉及将组蛋白变体正确递送至基因组。不同伴侣蛋白之间调控组蛋白变体向不同染色质结构域供应的相互作用在很大程度上仍未被阐明。我们报道了早幼粒细胞白血病（PML）蛋白在组蛋白变体H3.3向染色质路由以及在我们称为PAD的兆碱基大小异染色质PML相关结构域组织中的作用。PML缺失通过将组蛋白H3甲基化平衡从K9me3转向K27me3，改变PAD的异染色质状态。PML缺失损害ATRX和DAXX在PAD中沉积H3.3，但保留HIRA在这些区域的H3.3装载功能。我们的结果揭示了PML在染色质大规模组织中一个未被重视的作用，并证明ATRX/DAXX在PAD中沉积H3.3具有PML依赖性作用。我们的数据表明，当这些结构域的完整性受损时，HIRA装载H3.3和ATRX依赖性H3K27三甲基化构成确保异染色质维持的机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。