慢性淋巴细胞白血病未筛选RNA-seq读段免疫球蛋白转录序列与体细胞超突变计算
该数据集来自NCBI，聚焦慢性淋巴细胞白血病（CLL），包含1个文件（GSE66228_series_matrix.txt.gz），主题为高通量测序表达谱
基本信息
资源简介
慢性淋巴细胞白血病未筛选RNA-seq读段免疫球蛋白转录序列与体细胞超突变计算
Immunoglobulin transcript sequence and somatic hypermutation computation from unselected RNA-seq reads in Chronic Lymphocytic Leukemia
该数据集来自NCBI，聚焦慢性淋巴细胞白血病（CLL），包含1个文件（GSE66228_series_matrix.txt.gz），主题为高通量测序表达谱。源站描述指出IGHV突变状态是CLL的既定预后因素，并揭示肿瘤细胞生物学与功能；研究证明未筛选的下一代RNA测序能准确测定IGH@序列（含CDR3完整序列）及CLL细胞突变状态，可能替代基于Sanger测序的专用单用途检测。数据可用于IGHV转录序列与体细胞超突变计算及突变状态预测（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Feb 23 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：IGHV突变状态是慢性淋巴细胞白血病中一个公认的预后因素，并且也为肿瘤细胞生物学和功能提供了关键见解。目前，确定IGHV转录序列（据此计算突变状态）需要专门的实验室程序。RNA测序是一种提供高分辨率、高动态范围转录组数据的方法，可用于差异表达、异构体发现和变异确定。在本文中，我们证明未筛选的下一代RNA测序能够准确确定IGH@序列，包括互补决定区3（CDR3）的完整序列，以及CLL细胞的突变状态，有可能取代目前基于Sanger测序的专门单用途检测方法。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL11154、9606。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66228
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
IGHV突变状态是慢性淋巴细胞白血病中一个公认的预后因素，同时也为肿瘤细胞生物学和功能提供了关键见解。目前，确定IGHV转录本序列（据此计算突变状态）需要专门的实验室程序。RNA测序是一种提供高分辨率、高动态范围转录组数据的方法，可用于差异表达、异构体发现和变异确定。在本文中，我们证明未选择的下一代RNA测序能够准确确定IGH@序列，包括互补决定区3（CDR3）的完整序列以及CLL细胞的突变状态，有可能取代目前基于Sanger测序的专门单一用途检测方法。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
