GSE66186:慢性淋巴细胞白血病中p53依赖非编码RNA网络的smRNA测序分析

该数据集为一项small RNA测序研究,比较p53野生型与p53突变型慢性淋巴细胞白血病(CLL)样本在DNA损伤应答下的miRNA/非编码RNA表达谱,利用突变p53转录活性受损的特性,在原代CLL中定位p53靶标

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基因组分类GPL111549606
GSE66186: smRNA sequencing analysis to identify p53-dependent non-coding RNA networks in Chronic Lymphocytic Leukemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

GSE66186:慢性淋巴细胞白血病中p53依赖非编码RNA网络的smRNA测序分析

smRNA sequencing analysis to identify p53-dependent non-coding RNA networks in Chronic Lymphocytic Leukemia

该数据集为一项small RNA测序研究,比较p53野生型与p53突变型慢性淋巴细胞白血病(CLL)样本在DNA损伤应答下的miRNA/非编码RNA表达谱,利用突变p53转录活性受损的特性,在原代CLL中定位p53靶标。数据覆盖miRNA及lncRNA表达信息,可用于识别p53依赖的非编码RNA网络、研究p53功能缺失对CLL化疗耐药与预后相关分子机制的影响(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 23 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):肿瘤抑制因子p53的突变导致慢性淋巴细胞白血病(CLL)的化疗耐药和不良预后。通过比较p53野生型与p53突变型样本在DNA损伤应答下的miRNA/非编码RNA表达谱,我们利用突变p53受损的转录活性,通过small RNA测序在原代CLL中定位p53靶标。聚焦于miRNA,我们除关键p53靶标miR-34a外,还鉴定出一组p53依赖的miRNA(miR-182-5p、miR-7-5p、miR-320c/d)。在miRNA之外,长链非编码RNA(lncRNA)NEAT1和lincRNA-p21在功能性p53存在时响应DNA损伤而被诱导,但在p53突变的CLL中则不被诱导。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66186

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤抑制因子p53的突变导致慢性淋巴细胞白血病(CLL)的化疗耐药和不良预后。通过比较p53野生型和p53突变样本在DNA损伤应答中的miRNA/非编码RNA表达谱,我们利用突变p53转录活性受损的特点,通过小RNA测序在原发性CLL中绘制p53靶点图谱。聚焦于miRNA,我们鉴定了一组p53依赖性miRNA(miR-182-5p、miR-7-5p、miR-320c/d),此外还有关键的p53靶点miR-34a。除miRNA之外,长非编码RNA(lncRNA)NEAT1和lincRNA-p21在功能性p53存在时响应DNA损伤而被诱导,但在p53突变的CLL中则不然。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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