慢性淋巴细胞白血病细胞转录组分析与全基因组DNA甲基化图谱

资源简介

慢性淋巴细胞白血病细胞转录组分析与全基因组DNA甲基化图谱

GSE66167 是一项聚焦慢性淋巴细胞白血病细胞的组学数据集，同时涵盖转录组分析与全基因组 DNA 甲基化图谱两类信息，二者均通过下一代测序技术测定。该数据集由 NCBI 发布，作者为 Huidong Shi，发布时间为 Feb 20 201。数据集在本地分类中归入肿瘤 / 白血病方向，主题标签涉及高通量测序表达谱分析，并标注了 GPL10999 平台与物种编号 9606。数据集当前提供 1 个文件，样例文件名为 GSE66167_series_matrix.txt.gz，以 GZIP 压缩格式分发。整体而言，该数据集面向慢性淋巴细胞白血病的转录与表观遗传层面的研究需求，适合需要同时考察基因表达与 DNA 甲基化状态的探索性分析场景。

【数据集背景】

慢性淋巴细胞白血病是血液系统常见的恶性肿瘤之一，其发生发展涉及基因表达调控与表观遗传修饰的多层次改变。GSE66167 的源站标题为“Transcriptome analysis and Genome-wide DNA methylation maps in chronic lymphocytic leukemia cells determined by next-generation sequencing”，表明该数据集以慢性淋巴细胞白血病细胞为研究对象，借助下一代测序技术同时获取转录组表达信息与全基因组 DNA 甲基化图谱。源站描述指出，该 SuperSeries 由下方列出的若干 SubSeries 组成，说明其组织方式是将多个子系列汇总为一个上层集合，便于围绕同一研究主题进行统一检索与引用。

【数据内容】

数据集包含转录组分析与全基因组 DNA 甲基化图谱两类测定内容，均以慢性淋巴细胞白血病细胞为材料、由下一代测序技术产生。主题标签中的“Expression profiling by high throughput sequencing”对应表达谱分析方向，GPL10999 为平台标识，9606 为物种标识。当前可获取的文件数量为 1，样例文件为 GSE66167_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩包形式。该文件的具体字段构成、样本数量、分组信息与数据规模，源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Huidong Shi，发布时间为 Feb 20 201。数据由下一代测序技术测定，研究对象为慢性淋巴细胞白血病细胞。样本采集地点、采集时间、伦理审批与临床信息等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于慢性淋巴细胞白血病中基因表达谱与 DNA 甲基化图谱的联合观察，适用于转录组与表观遗传层面的探索性研究，例如表达与甲基化状态的对照分析、候选基因的筛选与验证思路设计等。由于同时覆盖转录组与全基因组甲基化两类信息，也适合作为方法学比较或流程测试的输入数据。具体研究结论与生物学发现，源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE66167_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。文件内部的具体字段含义与解析方式，源站未提供。

【质量与限制】

数据集当前仅提供 1 个文件，文件样例为系列矩阵压缩包；样本量、测序深度、数据完整性评估与质控指标等信息，源站未提供。使用时应注意其 SuperSeries 结构，具体子系列内容需另行查阅。数据的使用范围与再分发条件，源站未提供。

【引用与许可】

引用时应标注数据集编号 GSE66167 及作者 Huidong Shi，并注明来源站 ncbi.nlm.nih.gov。许可类型与使用条款，源站未提供。