GSE62533:凋亡抑制蛋白作为慢性淋巴细胞白血病有前景的治疗靶点
源站描述指出,凋亡抑制蛋白(IAP)在 CLL 细胞中高表达,BV6 可剂量依赖性诱导 51 例患者样本中 28 例(54%)发生细胞死亡,而健康供者 B 细胞基本不受影响;基因表达谱分析识别出细胞死亡和 NF-kB 信号通路

基本信息
资源简介
GSE62533:凋亡抑制蛋白作为慢性淋巴细胞白血病有前景的治疗靶点
Inhibitor of apoptosis proteins as promising therapeutic targets in chronic lymphocytic leukemia
该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE62533_series_matrix.txt.gz),基于 GPL570 芯片对人类(9606)慢性淋巴细胞白血病(CLL)样本进行表达谱分析。源站描述指出,凋亡抑制蛋白(IAP)在 CLL 细胞中高表达,BV6 可剂量依赖性诱导 51 例患者样本中 28 例(54%)发生细胞死亡,而健康供者 B 细胞基本不受影响;基因表达谱分析识别出细胞死亡和 NF-kB 信号通路。数据可用于研究 CLL 中 IAP 表达、药物敏感性与预后标志(如 VH 状态、TP53 突变、17p 缺失、Fludarabine 难治)的关系(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 20 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):凋亡抑制(IAP)蛋白在 CLL 细胞中高表达,可能有助于逃逸细胞死亡,导致治疗结局不佳。值得注意的是,具有不良预后特征的病例(例如 VH 状态未突变和 TP53 突变)对 BV6 的应答显著优于预后未知或良好的样本(例如 13q 缺失)。大多数 17p 缺失病例(10/12)和 Fludarabine 难治病例对 BV6 敏感,表明 BV6 的作用不依赖 p53 通路。重要的是,BV6 在 51 例受检患者样本中的 28 例(54%)中剂量依赖性诱导细胞死亡,而来自健康供者的 B 细胞基本不受影响。在模拟微环境的生存条件下(例如添加 CD40 配体或在条件培养基中),BV6 也触发了细胞死亡。基因表达谱分析将细胞死亡和 NF-kB 信号通路确定为……
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE62533
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
凋亡抑制蛋白(IAP)在慢性淋巴细胞白血病(CLL)细胞中高表达,可能参与细胞死亡逃逸,导致治疗预后不良。值得注意的是,预后不良病例(如VH状态未突变和TP53突变)对BV6的应答显著优于预后未知或良好(如13q缺失)的样本。大多数17p缺失病例(10/12)和氟达拉滨难治性病例对BV6敏感,表明BV6的作用不依赖于p53通路。重要的是,BV6在51例受检患者样本中的28例(54%)剂量依赖性诱导细胞死亡,而健康供者的B细胞基本不受影响。在模拟微环境的生存条件下(如添加CD40配体或在条件培养基中),BV6同样触发细胞死亡。基因表达谱分析确定细胞死亡和NF-κB信号通路是BV6调控的主要通路之一。数据证实BV6引起cIAP1和cIAP2降解及NF-κB通路激活。BV6诱导的细胞死亡依赖于活性氧的产生,因为加入ROS清除剂可显著挽救BV6触发的细胞死亡。
相比之下,BV6诱导的细胞死亡独立于caspase活性、RIP1活性或TNF-alpha,因为zVAD.fmk、necrostatin-1或TNF-alpha阻断抗体Enbrel均未能保护细胞免受死亡。值得注意的是,ROS调节蛋白的转录本受到BV6的调控。因此,这些数据对于开发克服CLL中细胞死亡抵抗的新治疗策略具有重要意义,尤其是在预后不良的亚组中。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




