GSE61504：长程增强子活性决定T细胞白血病中Myc对Notch抑制剂的敏感性

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE61504

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数据说明

Notch是T细胞发育所必需的，并且是T细胞急性淋巴细胞白血病中常见的致癌驱动因素。Myc是正常和恶性前T细胞中Notch的关键靶标，但Notch如何调控Myc尚不清楚。在此，我们鉴定了一个位于人类和小鼠Myc基因3’端超过1 Mb处的远端增强子，该增强子结合Notch转录复合物，并与Myc近端启动子发生物理相互作用。该区域中的Notch1结合元件以Notch依赖、细胞环境特异性的方式激活报告基因，且这一过程需要保守的Notch复合物结合位点。Notch激活的急性变化会在整个增强子区域（跨度超过600 kb）引起H3K27乙酰化的快速变化，这些变化与Myc表达相关。这一受Notch影响的广泛区域由一个包含多个结构域的增强子区域组成，这些结构域可被识别为离散的H3K27乙酰化峰。对Notch抑制剂产生耐药性的白血病细胞，尽管Notch转录复合物结合位点附近的增强子结构域发生表观遗传沉默，仍能表达Myc。

耐药细胞中Myc的不依赖Notch的表达对Brd4抑制剂高度敏感，这种药物敏感性的变化伴随着Myc启动子优先与更多3’增强子域结合，而这些增强子域的功能强烈依赖于Brd4。这些发现表明，长程增强子活性的改变可以介导对靶向治疗的耐药性，并为白血病中联合靶向Notch和Brd4提供了机制依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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