儿童急性淋巴细胞白血病孤立性中枢神经系统复发预测数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE60926

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景 在儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）中，中枢神经系统（CNS）受累在诊断时较为罕见（1-4%），但在复发时更为常见（约30%）。微小残留病诊断可预测大多数骨髓（BM）复发，但很可能无法预测孤立性CNS复发。因此，CNS复发可能变得相对更为重要。由于CNS治疗具有显著的远期后遗症，早期识别有CNS复发风险的患者至关重要。方法 比较来自脑脊液（CSF）的ALL细胞与来自BM的ALL细胞的基因表达谱，并通过实时定量PCR确认差异。对于一组选定的过表达基因，通过8色流式细胞术评估复发时CSF中ALL细胞及诊断时BM样本中ALL细胞的蛋白表达水平。结果 CSF来源的ALL细胞显示出与BM来源的ALL细胞明显不同的基因表达谱，差异表达基因（包括SCD和OPN）参与生存和凋亡通路，并与JAK-STAT通路相关。

流式细胞术分析显示，在后来发生中枢神经系统（CNS）复发的ALL患者中，诊断时骨髓（BM）中已存在一个具有“CNS特征”（SCD阳性且OPN表达增高）的ALL细胞亚群（>1%），而在几乎所有其他患者中该亚群<1%或缺失。结论：诊断时存在具有“CNS特征”的ALL细胞亚群可能预测孤立性CNS复发。该信息可用于设计新的诊断和治疗策略，旨在以较低的毒性预防CNS复发。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。