GSE53235:增殖性CLL亚群中miRNA-22激活PI3K/AKT通路(miRNA)

该数据集来自NCBI GEO,聚焦慢性淋巴细胞白血病(CLL)中增殖性亚群的microRNA表达。研究比较了进展型未突变CLL患者外周血中该白血病亚群的全局mRNA与microRNA表达,提示其增殖行为可能依赖microRNA-22过表达,进而诱导PTEN下调和PI3K/AKT通路激活

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基因组分类Non-coding RNA profiling by arrayGPL147679606
GSE53235: PI3K/AKT pathway is activated by miRNA-22 in the proliferative CLL subset (miRNA)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

GSE53235:增殖性CLL亚群中miRNA-22激活PI3K/AKT通路(miRNA)

PI3K/AKT pathway is activated by miRNA-22 in the proliferative CLL subset (miRNA)

该数据集来自NCBI GEO,聚焦慢性淋巴细胞白血病(CLL)中增殖性亚群的microRNA表达。研究比较了进展型未突变CLL患者外周血中该白血病亚群的全局mRNA与microRNA表达,提示其增殖行为可能依赖microRNA-22过表达,进而诱导PTEN下调和PI3K/AKT通路激活。数据包含1个文件(GSE53235_series_matrix.txt.gz),基于GPL14767芯片平台,适用于CLL增殖机制与miRNA调控研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 11 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):理解恶性B细胞与其微环境之间的相互作用,可为慢性淋巴细胞白血病(CLL)的分子与临床生物学提供线索。为生成新的治疗策略,不同团队研究了不同的CLL增殖组分。我们此前在进展型未突变CLL患者的外周血中鉴定出其中一个增殖亚群。由于该小亚群的存在似乎是增殖性疾病的标志,其中B淋巴细胞在这些患者增殖中心被组成性激活,我们对该白血病亚群进行了基因表达分析,比较其全局mRNA和microRNA表达。我们的结果提示,该组分的增殖行为似乎依赖于microRNA-22过表达,其诱导PTEN下调和PI3K/AKT通路激活。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL14767、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53235

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 19 201,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

理解恶性B细胞与其微环境之间的相互作用,可为慢性淋巴细胞白血病(CLL)的分子与临床生物学提供线索。为开发新的治疗策略,不同研究团队对不同的CLL增殖组分进行了研究。我们此前在进展型未突变CLL患者的外周血中鉴定出其中一个增殖亚群。由于该小亚群的存在似乎是增殖性疾病的一个标志——在这类患者中,B淋巴细胞在增殖中心被持续性激活——我们对该白血病亚群的整体mRNA和microRNA表达进行了基因表达分析比较。我们的结果提示,该组分的增殖行为似乎依赖于microRNA-22的过表达,后者诱导PTEN下调及PI3K/AKT通路激活。转染实验表明,CLL B细胞中miR-22过表达可启动PI3K/AKT,导致FOXO1失活、p27-Kip1下调以及Survivin和Ki-67蛋白过表达。

我们还证明了该通路可由CD40L/IL4等微环境信号触发,更重要的是,这一调控环路也存在于进展期UM患者的淋巴结中。总而言之,这些结果强调了PI3K/AKT通路在CLL增殖池生成中的关键作用,并为PI3K抑制剂的使用提供了依据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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