CLL中B细胞受体触发相关的基因表达研究（miRNA研究）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE52775

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

B细胞受体（BCR）在慢性淋巴细胞白血病（CLL）的发病机制和进展中发挥重要作用。我们通过用固定化抗IgM刺激CLL细胞，研究了BCR触发依赖性的microRNA调控。固定化抗IgM刺激的CLL细胞（n=16）的miRome分析显示，在未突变（UM）和突变（M）IGHV亚组中，miR-132均显著上调。平行的基因表达谱分析和旨在鉴定miR-132靶基因的计算机模拟分析，使我们聚焦于SIRT1，该基因编码一种组蛋白去乙酰化酶，可靶向包括TP53在内的多种蛋白质。我们确定了固定化抗IgM刺激后SIRT1蛋白水平降低（P=0.001），同时TP53乙酰化增加（P=0.0072）。TP53靶基因CDKN1A在固定化抗IgM刺激的CLL细胞中持续上调。值得注意的是，CLL病例（n=134）中miR-132的组成型表达水平与体外固定化抗IgM刺激的CLL细胞中获得的水平相当。此外，高miR-132表达水平在M型CLL患者中保持有利的预后影响（P=0.005），但在UM型CLL患者中则不然（P=0.968）。

所描述的miR-132/SIRT1/TP53轴，依次以BCR触发、miR-132上调、SIRT1下调和TP53乙酰化为特征，应当结合针对CLL中BCR通路的新兴药物来考虑。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。