CLL患者中独特基因与miRNA表达谱及定型亚群#4利用的关联[基因表达]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE51528

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

高度同源的B细胞受体，即定型BCR，在部分慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者中呈复发性表达。本研究在一个包含462例Binet A期CLL患者的前瞻性队列中，探讨了16例使用定型亚群#4 BCR（IGHV4-34）患者白血病细胞的生物学和分子特征。所有亚群#4患者均以IGHV基因突变构型和缺乏不良细胞遗传学病变以及NOTCH1和SF3B1突变为特征。基因表达谱分析显示，与其余IGHV突变患者相比，亚群#4患者白血病细胞中WDFY4、MF2A显著下调，PDGFA、FGFR1和TFEC基因上调。同样，亚群#4病例的细胞中存在特定的miRNA表达模式，涉及miR-497和miR-29c的上调。此外，将miR-497模拟物转染至原代白血病CLL细胞中可诱导BCL2下调，已知BCL2是该miRNA的已验证靶标。

我们的数据揭示了来自#4亚组患者细胞中独特的基因和miRNA表达谱，为进一步证实BCR在塑造白血病细胞特征中的假定作用提供了更多证据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。