GSE50572：与活化T细胞或表达CD40L的细胞共培养的CLL细胞的基因表达特征

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE50572

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数据说明

慢性淋巴细胞白血病（CLL）细胞在次级淋巴组织中增殖，但导致其增殖的机制仍不明确。除BCR触发的信号外，其他微环境因素很可能也参与其中。在增殖中心，白血病B细胞与CD4+CD40L+ T细胞密切接触。因此，我们在此剖析了自体活化T细胞（Tact）向CLL细胞提供的信号。尽管Tact诱导的基因表达谱与单独CD40信号诱导的基因表达谱高度相似，但一个明显差异是Tact诱导了CLL细胞的增殖。我们确定，仅用CD40L+IL-21刺激就足以诱导CLL细胞强烈增殖。随后，我们定义了CLL中由IL-21诱导的基因特征，其中包含JAK-STAT和凋亡通路的组分，并且该特征可在患者的淋巴结（LN）样本中检测到。最后，我们能够在LN中检测到IL-21 RNA和蛋白，以及LN CD4+CXCR5+滤泡辅助T细胞在离体条件下产生IL-21。这些结果表明，除BCR信号外，活化T细胞可能通过CD40和IL-21促进CLL细胞增殖。

靶向这些信号通路可能为CLL的治疗提供新的途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。