慢性期CML伊马替尼应答基因表达预测数据集

该数据集来自NCBI,标题为基于基因表达预测慢性期CML患者的伊马替尼应答。源站描述指出,TKI治疗CML的应答评估依赖ELN等既定标准,只能在治疗开始后分层患者;研究者利用治疗前晚期慢性期CML患者外周血样本的基因表达谱构建伊马替尼应答预测基因标签

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基因组预测Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE44589: Gene expression-based imatinib response prediction in chronic phase CML

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

慢性期CML伊马替尼应答基因表达预测数据集

Gene expression-based imatinib response prediction in chronic phase CML

该数据集来自NCBI,标题为基于基因表达预测慢性期CML患者的伊马替尼应答。源站描述指出,TKI治疗CML的应答评估依赖ELN等既定标准,只能在治疗开始后分层患者;研究者利用治疗前晚期慢性期CML患者外周血样本的基因表达谱构建伊马替尼应答预测基因标签。数据集含1个文件(GSE44589_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及表达谱芯片、GPL570平台和9606物种,可用于CML应答预测建模研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 22 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗慢性髓性白血病(CML)由预先定义的欧洲白血病网(ELN)或其他应答标准指导。这仅允许在治疗开始期间而非之前对患者进行分层。基于基因表达谱(GEP)的应答预测可能成为CML患者分层的宝贵工具,但迄今为止已发表的应答预测数据相互矛盾。我们通过GEP从晚期慢性期治疗前CML患者的外周血样本中生成了伊马替尼应答预测基因标签。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE44589

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 31 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性髓性白血病(CML)的酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗依据预先定义的欧洲白血病网(ELN)或其他疗效标准进行指导。这使得患者分层只能在治疗开始期间进行,而无法在治疗开始前进行。基于基因表达谱(GEP)的疗效预测可能成为CML患者分层的有价值工具,但迄今为止已发表的疗效预测数据相互矛盾。我们通过GEP从晚期慢性期初治CML患者的外周血样本中生成了一项伊马替尼疗效预测基因特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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