对照与LRF缺陷小鼠LT-HSC表达数据

该数据集来自 NCBI GEO(GSE41839),包含对照与 LRF(白血病/淋巴瘤相关因子)缺陷小鼠长期造血干细胞(LT-HSC)的基因表达芯片数据

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL126110090
GSE41839: Expression data from control and LRF (leukemia/lymphoma related factor)-deficient mouse LT-HSCs

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

对照与LRF缺陷小鼠LT-HSC表达数据

Expression data from control and LRF (leukemia/lymphoma related factor)-deficient mouse LT-HSCs

该数据集来自 NCBI GEO(GSE41839),包含对照与 LRF(白血病/淋巴瘤相关因子)缺陷小鼠长期造血干细胞(LT-HSC)的基因表达芯片数据。研究通过注射 polyinosinic polycytidylic acid 激活 Cre 后,对 LRF Flox/+ Mx1-Cre+ 与 LRF Flox/Flox Mx1-Cre+ 小鼠双分选 LT-HSC 提取总 RNA 进行微阵列分析,用于评估 LRF 缺失对 LT-HSC 转录组的影响。数据可用于白血病相关转录调控研究及差异表达分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 25 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):LRF 由 ZBTB7A 基因编码,旧称 POKEMON(POK 红系髓系致癌因子),最初被鉴定为与 BCL6(B 细胞淋巴瘤 6)相互作用的 PLZF(早幼粒细胞白血病锌指)同源物。LRF 是一种在造血谱系细胞中广泛表达的转录因子,但在成红细胞和生发中心(GC)B 细胞中表达尤其高。本研究的目的是评估 LRF 缺失对 LT-HSC 转录组的影响。给成年小鼠注射聚肌苷酸聚胞苷酸(pIpc)以激活 Cre 九天后,从 LRF Flox/+ Mx1-Cre+ 和 LRF Flox/Flox Mx1-Cre+ 小鼠双分选的 LT-HSC 中分离总 RNA,并进行微阵列分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL1261、10090。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE41839

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 11 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

LRF由ZBTB7A基因编码,旧称POKEMON(POK红系髓系发育因子),最初被鉴定为与BCL6(B细胞淋巴瘤6)相互作用的PLZF(早幼粒细胞白血病锌指蛋白)同源物。LRF是一种在造血谱系细胞中广泛表达的转录因子,但在成红细胞和生发中心(GC)B细胞中表达尤其高。本研究旨在评估LRF缺失对LT-HSC转录组的影响。给成年小鼠注射聚肌苷酸聚胞苷酸(pIpc)以激活Cre后第九天,从LRF Flox/+ Mx1-Cre+和LRF Flox/Flox Mx1-Cre+小鼠中双重分选LT-HSC并提取总RNA,进行微阵列分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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