健康与恶性CLL人类B淋巴细胞BCR刺激后表达数据

该数据集来自NCBI GEO,包含健康B淋巴细胞与慢性淋巴细胞白血病(CLL)B淋巴细胞在体外经抗IgM抗体刺激激活B细胞受体后的基因表达谱

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE39411: Expression data from healthy and malignant (chronic lymphocytic leukemia, CLL) human B-lymphocytes after B-cell receptor stimulation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

健康与恶性CLL人类B淋巴细胞BCR刺激后表达数据

Expression data from healthy and malignant (chronic lymphocytic leukemia, CLL) human B-lymphocytes after B-cell receptor stimulation

该数据集来自NCBI GEO,包含健康B淋巴细胞与慢性淋巴细胞白血病(CLL)B淋巴细胞在体外经抗IgM抗体刺激激活B细胞受体后的基因表达谱。样本覆盖6例健康、6例惰性CLL和5例侵袭性CLL,在60、90、210和390分钟四个时间点分别测量刺激与未刺激对照细胞。数据可用于比较不同来源B细胞在BCR激活后的转录差异,支持CLL相关分子分型与差异表达研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 17 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):三种不同的细胞群体(6例健康B淋巴细胞、6例惰性型白血病CLL B淋巴细胞和5例侵袭性型白血病CLL B淋巴细胞)在体外用抗IgM抗体刺激,激活B细胞受体(BCR)。我们在4个时间点(60、90、210和390分钟)分析基因表达。每个基因表达测量均在刺激细胞和未刺激对照细胞中进行。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE39411

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三个不同的细胞群体(6个健康B淋巴细胞、6个惰性型白血病CLL B淋巴细胞和5个侵袭性型白血病CLL B淋巴细胞)在体外用抗IgM抗体刺激,激活B细胞受体(BCR)。我们在4个时间点(60、90、210和390分钟)分析了基因表达。每个基因表达测量均在受刺激细胞和对照未刺激细胞中进行。对于一例侵袭性CLL病例,我们通过转染DUSP1特异性RNAi沉默DUSP1的表达,并作为对照,将细胞转染非靶向RNAi。随后我们刺激这些细胞的BCR,并在相同时间点分析受刺激细胞和对照未刺激细胞中的基因表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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