venetoclax耐药MV4-11急性髓系白血病细胞转录组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349945

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

获得性耐药严重限制了急性髓系白血病（AML）的持久缓解。为确定对机制不同的药物耐药的AML细胞是否共享共同的生存依赖，我们构建了FLT3-ITD阳性MV4-11细胞系的维奈克拉耐药衍生株（MV4-11 ABT199/R3），并对亲本细胞和耐药细胞进行了RNA测序。这些数据与公开可用的MV4-11米哚妥林耐药（GSE61786）和索拉非尼耐药（GSE74666）数据集进行了比较。在各耐药模型中共同上调的基因形成了一个紧密的蛋白质-蛋白质相互作用网络，包含10个枢纽基因（TLR4、PECAM1、CYBB、CXCL8、CASP8、ICAM1、CD33、CCL5、CD36、JUN），并富集于MAPK/ERK信号通路，尤其是ERK1/2活化。维奈克拉耐药细胞对MEK抑制剂司美替尼比亲本细胞更敏感，后者诱导G0/G1期阻滞，且MEK与mTOR联合抑制具有协同作用。这些数据表明，耐药的MV4-11细胞汇聚于一个ERK依赖性生存程序，该程序可能成为基于MEK的联合治疗的靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。