huCART19 T细胞间歇抗原再刺激后的单细胞RNA与TCR图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE349791

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数据说明

CD19靶向CAR T（CAR19）治疗后持久缓解与长期存续相关，但存续的细胞状态及驱动因素仍不明确。本研究将多模态单细胞图谱分析与克隆型追踪相结合，以表征慢性淋巴细胞白血病和大B细胞淋巴瘤患者中罕见、具有功能且持续存在的CAR19细胞。跨疾病和CAR结构，存续细胞汇聚于一种不同于内源性T细胞的状态，其特征为TCR共受体下调、抗原经历标志物上调、应激适应程序以及持续的细胞周期活动。我们将这一独特的转录/功能状态称为适应性重塑细胞（ARC）状态，因其有别于记忆状态或祖耗竭状态。体外建模显示，ARC CAR T细胞在反复的抗原暴露和靶细胞清除循环后产生，形成双阴性T细胞表型（TCRαβ+CD4-CD8α-），其终末分化和耗竭相关特征减弱，细胞毒性得以保留，且与匹配的CD8⁺ CAR T细胞相比增殖和细胞因子产生增强。

这些发现表明，反复的抗原接触是适应性CAR T细胞重塑的驱动因素，并提示ARC状态代表一种更广泛的T细胞命运，其产生于既不同于急性清除、也不同于慢性抗原持续存在的抗原条件之下。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。