GSE329580:ZNF292突变损害RNA与蛋白质生物合成并定义早期慢性淋巴细胞白血病的不良预后亚群
研究聚焦慢性淋巴细胞白血病(CLL)中复发性ZNF292改变,评估其在早期CLL中的预后价值,并整合患者转录组与CRISPR/Cas9实验探索分子机制

基本信息
资源简介
GSE329580:ZNF292突变损害RNA与蛋白质生物合成并定义早期慢性淋巴细胞白血病的不良预后亚群
ZNF292 mutations impair RNA and protein biosynthesis defining an adverse prognostic subset in early-stage chronic lymphocytic leukemia
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE329580_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序的表达谱数据,物种为人类(9606),平台为GPL21697。研究聚焦慢性淋巴细胞白血病(CLL)中复发性ZNF292改变,评估其在早期CLL中的预后价值,并整合患者转录组与CRISPR/Cas9实验探索分子机制。数据可用于分析ZNF292突变与首次治疗时间及总生存期的关联,识别早期CLL高危亚群,并支持RNA与蛋白质生物合成相关机制研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 30 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):ZNF292改变在慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者中被反复检出,3%-6%表现为突变,2%表现为6q缺失。尽管既往研究提示ZNF292突变具有独立预后作用,但其在早期CLL中的临床相关性及潜在生物学机制仍不明确。在此,我们在一个独立队列中评估了ZNF292改变的预后相关性,重点关注早期疾病。这些突变与更短的首次治疗时间(TTFT;中位25 vs. 52个月,P = .009)和更差的总生存期(OS,中位93 vs. 148个月,P = .004)相关。重要的是,ZNF292改变独立预测更短的TTFT和OS,在早期CLL中识别出一个高风险亚组。为阐明潜在分子机制,我们整合了CLL患者的转录组分析及CRISPR/Cas9-
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL21697、9606。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329580
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 07 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
ZNF292改变在慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者中被反复检出,其中3%-6%为突变,2%为6q缺失。尽管既往研究提示ZNF292突变具有独立预后意义,但其在早期CLL中的临床相关性及潜在生物学机制仍未明确。在此,我们在一个独立队列中评估了ZNF292改变的预后相关性,重点关注早期疾病。这些突变与较短的首治时间(TTFT;中位25个月 vs. 52个月,P = .009)和较差的总生存期(OS,中位93个月 vs. 148个月,P = .004)相关。重要的是,ZNF292改变可独立预测较短的TTFT和OS,从而识别出早期CLL中的高危亚组。为阐明潜在分子机制,我们整合了CLL患者的转录组分析及CRISPR/Cas9编辑的同基因模型。该分析揭示,ZNF292突变抑制整体RNA和蛋白质生物合成,并调控细胞周期进程。此外,ZNF292缺陷通过CHK1激活缺陷损害复制应激反应,导致DNA损伤积累。
在评估潜在的治疗脆弱性时,ZNF292突变细胞对依鲁替尼和维奈托克表现出增强的敏感性。总体而言,这些发现表明ZNF292变异可作为早期CLL的独立预后标志物,为其在疾病进展中的作用提供了新的机制见解。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




