视黄酸受体转录辅调节因子RIP140预测急性髓系白血病不良预后并限制ATRA反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325763

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数据说明

尽管急性髓系白血病（AML）的治疗取得了进展，但除急性早幼粒细胞白血病（APL）外，总体生存率仍然较差；在APL中，全反式维甲酸（ATRA）显著改善了预后。然而，ATRA在非APL的AML中疗效有限，这凸显了需要生物标志物来识别对分化诱导治疗有反应的患者。在此，我们证明转录辅调节因子RIP140在造血干细胞、未成熟AML原始细胞及复发时表达上调，并且在大多数AML亚型中（除APL外）作为不良预后因素，而在APL中高表达与更好的ATRA反应预测相关。对RIP140沉默的MOLM14细胞进行RNA-seq分析显示，RIP140并未阻断ATRA诱导的髓系分化，而是对其进行了重定向：在表达RIP140的细胞中，ATRA增强了免疫细胞活化和线粒体代谢，同时抑制了细胞周期和DNA复制/修复通路。RIP140沉默增强了ATRA对染色质、转录和大分子生物合成的影响，而RIP140则将ATRA的抑制作用转向翻译控制和泛素-蛋白酶体介导的蛋白质降解。

与这种转录重编程一致，RIP140敲低增强了ATRA诱导的分化、凋亡和增殖阻滞。这些发现将RIP140定位为一种新型生物标志物和潜在治疗靶点，以优化非APL AML患者对ATRA的应答。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。