GSE322732：CEBPD 在急性髓系白血病中作为抑癌基因

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE322732

标准获取流程：

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数据说明

持续需要识别急性髓系白血病（AML）的新疾病驱动因素，因为许多患者经历复发且临床结局不佳。通过对一项研究数据集中的配对诊断和复发样本（n = 59）进行基因组分析，我们发现在复发时CCAAT增强子结合蛋白δ（CEBPD）表达反复下调，并推断CEBPD是部分复发患者基因转录的关键调控因子之一。三个独立的公共数据集验证了复发时CEBPD表达的下调，并预测其为AML中的候选抑癌基因。为了评估CEBPD的抑癌功能，我们在人AML细胞系OCI-AML2和OCI-AML5中进行了互补的功能缺失和功能获得实验。与预测一致，敲低CEBPD表达导致MAPK信号激活以及下游效应分子cyclin D1和TNFα表达上调，同时白血病生长增加，而CEBPD过表达则导致细胞系中髓系分化标志物CD14表达的诱导。

与既往报道一致，我们的整合基因组分析和阿扎胞苷治疗实验进一步提示，DNA甲基化在AML进展过程中对CEBPD表达下调起作用。总体而言，我们的结果为CEBPD在人类细胞系中的抑癌功能提供了直接的功能性证据，并支持了先前关于其在人类AML中表观遗传沉默的研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。