IKAROS 重新表达调控 IKZF1 突变 Ph+ B-ALL 转录网络 [ChIP-Seq]

该数据集来自 NCBI,聚焦 IKZF1 突变的费城染色体阳性 B 细胞急性淋巴细胞白血病(Ph+ B-ALL),旨在研究 IKAROS(IKZF1)调控的抑癌机制

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基因组分类GPL184609606
GSE310890: IKAROS re-expression modulates transcriptional networks in IKZF1-mutant Ph+ B-ALL [ChIP-Seq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

IKAROS 重新表达调控 IKZF1 突变 Ph+ B-ALL 转录网络 [ChIP-Seq]

IKAROS re-expression modulates transcriptional networks in IKZF1-mutant Ph+ B-ALL [ChIP-Seq]

该数据集来自 NCBI,聚焦 IKZF1 突变的费城染色体阳性 B 细胞急性淋巴细胞白血病(Ph+ B-ALL),旨在研究 IKAROS(IKZF1)调控的抑癌机制。数据包含经工程化改造、可表达多西环素诱导型野生型 IKAROS(IK1)或空载体对照的人 MXP5 与 PDX2 细胞系的 bulk RNA-seq 图谱,诱导后 24 小时收集 RNA 以捕捉 IK1 重新表达的早期转录响应。该数据属于整合 RNA-seq、ChIP-seq、CUT&RUN、ATAC-seq 与 HiChIP 的大型多组学研究的一部分,可用于解析 IKZF1 缺陷型 Ph+ B-ALL 中 IKAROS 调控的转录与染色质网络(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 21 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):旨在研究 IKAROS(IKZF1)在携带 IKZF1 突变的费城染色体阳性 B 细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)中调控的抑癌机制。该数据集包含来自人 MXP5 和 PDX2 细胞系的 bulk RNA-seq 图谱,这些细胞系经工程化改造以表达多西环素诱导型野生型 IKAROS(IK1)或空载体对照。在诱导后 24 小时收集 RNA,以捕捉对 IK1 重新表达的早期转录响应。这些数据是整合 RNA-seq、ChIP-seq、CUT&RUN、ATAC-seq 和 HiChIP 的大型多组学研究的一部分,用于定义 IKZF1 缺陷型 Ph⁺ B-ALL 中 IKAROS 调控的转录和染色质网络。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18460、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE310890

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 21 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探究在携带IKZF1突变的费城染色体阳性B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)中,由IKAROS(IKZF1)调控的肿瘤抑制机制。该数据集包含来自人MXP5和PDX2细胞系的大量RNA-seq图谱,这些细胞系经过工程改造,能够表达多西环素诱导的野生型IKAROS(IK1)或空载体对照。在诱导后24小时收集RNA,以捕捉对IK1重新表达的早期转录反应。这些数据是一项更大规模多组学研究的一部分,该研究整合了RNA-seq、ChIP-seq、CUT&RUN、ATAC-seq和HiChIP,旨在定义IKZF1缺陷型Ph⁺ B-ALL中IKAROS调控的转录和染色质网络。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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