Pociredir抑制PRC2并在健康与镰状细胞病模型中诱导胎儿血红蛋白

该数据集来自NCBI GEO,标题为Pociredir抑制polycomb repressive complex 2并在健康与镰状细胞病模型中诱导胎儿血红蛋白,属于肿瘤/白血病分类

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基因组分类GPL342849606
GSE309131: Pociredir inhibits polycomb repressive complex 2 and induces fetal hemoglobin in healthy and sickle cell disease models [dataset1]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

Pociredir抑制PRC2并在健康与镰状细胞病模型中诱导胎儿血红蛋白

Pociredir inhibits polycomb repressive complex 2 and induces fetal hemoglobin in healthy and sickle cell disease models [dataset1]

该数据集来自NCBI GEO,标题为Pociredir抑制polycomb repressive complex 2并在健康与镰状细胞病模型中诱导胎儿血红蛋白,属于肿瘤/白血病分类。数据包含1个文件GSE309131_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序表达谱技术,平台为GPL34284,物种为9606。研究关注PRC2调控BCL11A表达及HBG1/2表达,可用于探索胎儿血红蛋白调控网络及镰状细胞病、b-地中海贫血的潜在治疗靶点(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 25 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):镰状细胞病(SCD)和b-地中海贫血由血红蛋白b基因(HBB)突变引起,导致成人血红蛋白蛋白功能异常。然而,携带额外遗传改变使成年期胎儿血红蛋白(HbF)表达升高的患者疾病严重程度减轻。HbF适度升高可提供临床获益,而大幅升高似乎可导致无症状疾病。阐明控制HbF表达的调控网络对于发现SCD和b-地中海贫血的新疗法至关重要。B细胞淋巴瘤/白血病11A(BCL11A)已被证明是抑制成人胎儿血红蛋白基因(HBG1/2)表达的主调控因子。我们表明,polycomb repressive complex 2(PRC2)在红系祖细胞中调控BCL11A表达,因此是HBG1/2表达的推定上游调控因子。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE309131

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

镰状细胞病(SCD)和β-地中海贫血是由血红蛋白β基因(HBB)突变引起的,这些突变导致成年血红蛋白蛋白功能异常。然而,携带额外遗传改变从而在成年期提高胎儿血红蛋白(HbF)表达的患者,其疾病严重程度会减轻。HbF适度升高即可带来临床获益,而大幅升高似乎可导致无症状疾病。阐明调控HbF表达的调控网络对于发现SCD和β-地中海贫血的新疗法至关重要。B细胞淋巴瘤/白血病11A(BCL11A)已被证明是抑制成年人胎儿血红蛋白基因(HBG1/2)表达的主调控因子。我们发现,多梳抑制复合物2(PRC2)在红系祖细胞中调控BCL11A的表达,因此是HBG1/2表达的推定上游调控因子。

此外,我们证明,通过不同的药理学或遗传学敲低方法对PRC2活性进行负向调节,可在体外和体内镰状细胞病(SCD)模型中导致BCL11A表达降低,并伴随HBG1/2 mRNA和HbF蛋白(或其直系同源物)的稳健增加。这些新发现进一步阐明了HBG1/2表达的调控网络,并对使用PRC2抑制剂作为SCD和β-地中海贫血的潜在疗法具有重要意义。抑制胚胎外胚层发育(EED),PRC2的一个关键亚基,在调节该复合物的活性方面尤为有效。这些发现的转化正在进行中,因为pociredir(FTX-6058),一种新型强效EED抑制剂,目前正在临床研究中评估作为特定血红蛋白病的潜在治疗方法(NCT05169580)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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