GSE308646：联合靶向从头嘧啶合成与ATR促进TP53缺陷型ALL中ATF4介导的细胞死亡

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308646

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数据说明

影响TP53基因的突变或缺失预示复发性急性淋巴细胞白血病（ALL）结局不良，可用的治愈性治疗选择有限。由于ALL细胞高度增殖，其强烈依赖核苷酸合成。二氢乳清酸脱氢酶（DHODH）是嘧啶从头生物合成的关键酶，其抑制剂已在部分ALL和急性髓系白血病（AML）临床前模型中显示出有前景的单药疗效。利用同基因TP53细胞系模型和患者来源异种移植（PDX）模型，我们发现双重抑制DHODH与共济失调毛细血管扩张症和Rad3相关蛋白（ATR）可产生显著的抗白血病效应，且不受TP53状态影响。通过整合转录组学和代谢组学分析，我们发现联合抑制DHODH和ATR导致葡萄糖向TCA循环的通量减少，并伴随氧化应激增加。这种代谢表型通过一种汇聚于激活转录因子4（ATF4）的机制触发细胞死亡；ATF4是细胞对代谢和氧化应激反应的关键整合因子，其作用在很大程度上不依赖p53。

综上所述，我们的研究结果揭示了ATF4介导的细胞死亡是TP53缺陷型急性淋巴细胞白血病中一种此前未被认识到的脆弱性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。