富血小板纤维蛋白诱导U937巨噬细胞炎症表型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308204

标准获取流程：

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数据说明

富血小板纤维蛋白（PRF）被广泛用于支持局部愈合，而这一过程需要巨噬细胞短暂极化为炎症表型。一般而言，PRF和血凝块成分可能激发这种巨噬细胞反应。为验证这一假设，我们进行了一项筛选试验，以确定巨噬细胞对PRF的整体反应。为此，将U937（一种组织细胞淋巴瘤细胞系）和THP1（一种白血病细胞系）——两者均为研究巨噬细胞反应的常用生物测定模型——暴露于PRF裂解物中。通过bulk RNA测序鉴定转录组变化。分析基于校正p值p<0.05的显著调控基因。在U937巨噬细胞中，与我们的假设一致，上调基因的聚类分析揭示了趋化因子活性（CCL2、CCL3、CCL4、CCL5、CCL7、CCL8、CCL20、CCL23、CCL26、CXCL5、CXCL6、CXCL8、CXCL16和PPBP）、RAGE受体结合（FPR1、S100A8、S100A9和S100A12）、IgG结合（FCGR1A、FCGR2A、FCGR2B、FCGR3A）、前列腺素生物合成过程（CBR1、CD74、EDN1、FABP5、IL1B、MIF、PTGES、PTGS1）以及胶原蛋白分解代谢过程（CTSL、FAP、MMP3、MMP7、MMP9、MMP12、MMP14、MMP19和MRC2）。

在THP1细胞中，聚类分析仅凸显了类固醇生物合成。这些发现强调，U937是一种合适的生物测定方法，用于研究PRF暴露后炎症性巨噬细胞的极化，这与早期伤口愈合过程中的临床巨噬细胞特征一致，并具有在慢性伤口中恢复炎症性巨噬细胞的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。