线粒体钙单向转运体调控CD8+ T细胞干性程序及同种免疫反应 [RNAseq 1]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306362

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

干性程序维持上皮组织中的同种反应性CD8+ T细胞池，从而介导移植物抗宿主病（GVHD）。尽管pan Ca2+信号抑制治疗可抑制T细胞活化，但保留干性程序，且无法阻止慢性期GVHD的发展，同时增加肿瘤复发和感染的风险。特定Ca2+通道是否决定T细胞同种反应性仍有待揭示。在此，我们发现线粒体钙单向转运体（MCU）调控同种反应性CD8+ T细胞的干性程序。Mcu的基因敲除损害了干性基因的转录，并促进同种反应性CD8+ T细胞耗竭的发展。机制上，Mcu缺失在TCR刺激期间增加了NF-κB活性，提高了CD25水平，从而增强了对IL2的敏感性。活化后，Mcu表达被内在调回基线水平。Mcu的异位表达降低了促生存干性基因的表达，并增强了再刺激诱导的细胞死亡（RICD），从而消除了同种反应性CD8+ T细胞的GVHD诱导能力。

使用FDA批准的抗疟药物青蒿琥酯对MCU功能进行药理学增强，可减轻GVHD，同时保留抗白血病效力。这些发现揭示了MCU调控同种反应性CD8+ T细胞中的干性程序，突显了靶向MCU的遗传或药理学方法在调节T细胞同种免疫中的转化潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。