墨西哥儿童急性淋巴细胞白血病DNA甲基化特征数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE306095

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性淋巴细胞白血病（ALL）是全球最常见的儿童癌症，在墨西哥人群中观察到更高的发病率和更低的生存率。本研究旨在表征一组墨西哥儿童ALL患者队列的全基因组DNA甲基化图谱。在诊断时收集了53名17岁以下B细胞ALL患儿的骨髓（BM）或外周血（PB）样本，以及5名儿童非ALL对照的BM样本。使用Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0芯片进行DNA甲基化谱分析。数据处理和差异甲基化位点（DMPs）的鉴定使用R语言中的ChAMP包进行。该数据集为研究这一研究不足人群中基于甲基化的生物标志物和失调通路提供了全面的表观基因组资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。