酪蛋白激酶1δ/ε抑制通过细胞内在与微环境机制抑制CLL [RNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305855

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性淋巴细胞白血病（CLL）是血液和淋巴器官中病理性B细胞积聚的结果。由于高度难治性，CLL被认为不可治愈，这要求新的治疗选择。此前，我们展示了酪蛋白激酶1δ/ε（CK1δ/ε）抑制延长了患有CLL样疾病的Eµ-TCL1小鼠的生存期。在此，我们阐明了介导CK1δ/ε抑制在CLL抑制中疗效的机制。使用体内Eµ-TCL1过继转移（AT）模型，我们展示了CK1δ/ε抑制介导细胞周期减慢和CLL细胞在S/G2界面的积聚。这一观察结果通过多种CLL细胞系和体内应用的EdU/Click-iT反应得到验证。此外，我们展示了CK1δ/ε抑制导致淋巴结（LN）中T细胞减少。使用体外模拟LN微环境的系统，我们观察到CK1δ/ε抑制触发了核因子κB（NFκB）通路的下调，该通路作用于T细胞介导的CD40L:CD40刺激的下游，诱导CLL细胞增殖。最后，我们展示了CK1δ/ε抑制抵消了来自广泛患者的CLL细胞的增殖，仅在携带TP53缺陷的患者中疗效较低。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。