MV4-11、Kasumi-1和KG-1细胞经HDAC8抑制剂22d处理的RNA-seq数据

该数据集为MV4-11、Kasumi-1和KG-1三种白血病细胞系经HDAC8抑制剂22d(10 μM)处理及相应对照组的RNA-seq数据,测序reads经处理后生成基因水平计数矩阵

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基因组回归GPL246769606
GSE305655: RNA-seq data of MV4-11, Kasumi-1, and KG-1 cells treated with HDAC8 inhibitor 22d 10 μM and control

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

MV4-11、Kasumi-1和KG-1细胞经HDAC8抑制剂22d处理的RNA-seq数据

RNA-seq data of MV4-11, Kasumi-1, and KG-1 cells treated with HDAC8 inhibitor 22d 10 μM and control

该数据集为MV4-11、Kasumi-1和KG-1三种白血病细胞系经HDAC8抑制剂22d(10 μM)处理及相应对照组的RNA-seq数据,测序reads经处理后生成基因水平计数矩阵。数据覆盖三种细胞系在药物处理与对照条件下的基因表达信息,可用于下游基因表达分析及处理组与对照组之间的比较研究,服务于白血病相关转录组差异表达与药物响应分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 18 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们对经10 μM HDAC8抑制剂22d处理的MV4-11、Kasumi-1和KG-1白血病细胞系及其各自的对照组进行了RNA测序。测序reads经处理后生成基因水平计数矩阵。该数据集提供处理后的计数数据,用于下游基因表达分析以及处理组与对照组之间的比较。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305655

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 22 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们对经10 μM HDAC8抑制剂22d处理的MV4-11、Kasumi-1和KG-1白血病细胞系及其各自对照组进行了RNA测序。测序读段经过处理,生成了基因水平的计数矩阵。该数据集提供了经过处理的计数数据,可用于下游基因表达分析以及处理组与对照组之间的比较。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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