大麻二酚作用于慢性髓性白血病细胞系的生物信息学差异表达分析数据集

该数据集来自 NCBI GEO,针对伊马替尼敏感的慢性髓性白血病 K-562S 细胞系,在 CBD(IC50: 17.69 μM)处理 4 小时和 12 小时后进行 RNA 测序,识别差异表达基因

geo
浏览 8
基因组分类GPL280389606
GSE305108: Bioinformatics differential expression analysis of the effect of cannabidiol in chronic myeloid leukemia cell line

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

大麻二酚作用于慢性髓性白血病细胞系的生物信息学差异表达分析数据集

Bioinformatics differential expression analysis of the effect of cannabidiol in chronic myeloid leukemia cell line

该数据集来自 NCBI GEO,针对伊马替尼敏感的慢性髓性白血病 K-562S 细胞系,在 CBD(IC50: 17.69 μM)处理 4 小时和 12 小时后进行 RNA 测序,识别差异表达基因。连续转录组分析显示 12 小时有 3518 个 DEGs,4 小时有 3433 个 DEGs。数据可用于研究 CBD 在白血病中的分子机制及差异表达分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 11 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性髓性白血病(CML)是首个与特定遗传异常——费城染色体(携带 BCR-ABL1 融合癌基因)相关的多能干细胞克隆性骨髓增殖性疾病。控制 CML 慢性期的首选治疗是酪氨酸激酶抑制剂(TKIs),但耐药病例需要替代治疗。大麻二酚(CBD)是大麻油的主要成分之一,在多种恶性肿瘤中发挥广泛的药理作用,但其在白血病中的分子机制仍不清楚。在本研究中,对伊马替尼敏感的 K-562S 细胞进行 CBD 处理(IC50: 17.69 μM)4 和 12 小时,随后进行 RNA 测序以识别差异表达基因(DEGs)。连续转录组分析显示,处理 12 小时有 3518 个 DEGs,处理 4 小时有 3433 个 DEGs。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL28038、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305108

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 21 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305108

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性髓性白血病(CML)是首个被发现与特定遗传异常相关的多能干细胞克隆性骨髓增殖性疾病,该遗传异常为携带BCR-ABL1融合癌基因的费城染色体。控制CML慢性期的首选治疗药物是酪氨酸激酶抑制剂(TKIs),但对于耐药病例仍需替代治疗。大麻二酚(CBD)是大麻油的主要成分之一,在多种恶性肿瘤中发挥广泛的药理作用,但其在白血病中的分子机制尚不清楚。在本研究中,对伊马替尼敏感的K-562S细胞进行CBD处理(IC50:17.69 μM)4小时和12小时,随后进行RNA测序以鉴定差异表达基因(DEGs)。

连续转录组分析显示,治疗12小时和4小时分别有3518个和3433个差异表达基因,表明金属硫蛋白调控的氧化应激反应(MT1、MT2、SLC30A2)、p53介导的细胞凋亡(TP53TG3、DDIT4、BBC3、CHAC1、NOXA1、DAPK2)发生显著调节,免疫信号通路发生改变,包括I型干扰素激活、PI3K-Akt-mTOR和Toll样受体信号通路,这些在白血病进展中至关重要,同时脂质代谢和线粒体稳态也发生变化。本研究的结果进一步证实了CBD在K-562S细胞中诱导与免疫调节、细胞凋亡和代谢过程相关的广泛转录和信号改变的巨大潜力。这些发现为CBD的治疗潜力提供了新的见解,并为其在血液恶性肿瘤中的精准应用进一步研究奠定了基础。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案