急性髓系白血病患者白血病细胞的单细胞转录组与3D基因组图谱
该数据集来自急性髓系白血病（AML）患者骨髓穿刺样本中的CD34⁺CD117⁺CD38⁻造血干/祖细胞（HSPC），采用名为HiRES的单细胞多组学方法，在同一细胞内同时检测染色质结构与转录组
基本信息
资源简介
急性髓系白血病患者白血病细胞的单细胞转录组与3D基因组图谱
Single-cell transcriptomic and 3D genome atlas of leukemia cells from patients with acute myeloid leukemia (AML)
该数据集来自急性髓系白血病（AML）患者骨髓穿刺样本中的CD34⁺CD117⁺CD38⁻造血干/祖细胞（HSPC），采用名为HiRES的单细胞多组学方法，在同一细胞内同时检测染色质结构与转录组。这是单细胞HiRES在原发性AML样本中的首次应用，提供单细胞分辨率的配对3D基因组与基因表达信息。数据可用于研究AML中染色质构象与基因表达的关系，支持白血病细胞异质性分析及多组学整合分析（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jul 10 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们应用了一种名为“Hi-C and RNA-seq employed simultaneously”（HiRES）的单细胞多组学检测方法，在同一细胞内同时分析染色质结构和转录组。在本研究中，该检测方法应用于从急性髓系白血病（AML）患者骨髓穿刺液中分离的CD34⁺CD117⁺CD38⁻造血干/祖细胞（HSPCs）。该数据集代表了单细胞HiRES在原发性AML样本中的首次应用，提供了单细胞分辨率的配对3D基因组和基因表达信息。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Other、GPL34284、9606。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302267
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 13 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们采用了一种名为“同时应用Hi-C和RNA-seq”（HiRES）的单细胞多组学检测方法，以在同一细胞内同时描绘染色质结构和转录组。在本研究中，该检测方法应用于从急性髓系白血病（AML）患者骨髓穿刺样本中分离出的CD34⁺CD117⁺CD38⁻造血干/祖细胞（HSPCs）。此数据集标志着单细胞HiRES技术在原发性AML样本中的首次应用，提供了单细胞分辨率下的配对三维基因组和基因表达信息。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
