EZH2抑制引起的表观遗传变化增加高AID活性或DNA修复缺陷B细胞的易位[HTGTS in MEC-1]
该数据集来自NCBI,包含MEC-1人B细胞中通过HTGTS技术检测的染色体易位数据,用于研究EZH2抑制剂(tazemetostat和valemetostat)对AID介导的染色体易位模式的影响
![GSE297736: Epigenetic changes by EZH2 inhibition increase translocations in B cells with high AID activity or DNA repair deficiency [HTGTS in MEC-1]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/173965.jpg)
基本信息
资源简介
EZH2抑制引起的表观遗传变化增加高AID活性或DNA修复缺陷B细胞的易位[HTGTS in MEC-1]
Epigenetic changes by EZH2 inhibition increase translocations in B cells with high AID activity or DNA repair deficiency [HTGTS in MEC-1]
该数据集来自NCBI,包含MEC-1人B细胞中通过HTGTS技术检测的染色体易位数据,用于研究EZH2抑制剂(tazemetostat和valemetostat)对AID介导的染色体易位模式的影响。数据覆盖EZH2抑制剂单药及联合PI3Kδ抑制条件下的易位频率变化,可用于分析表观遗传调控与B细胞基因组不稳定性之间的关系(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 21 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):EZH2组蛋白甲基转移酶抑制剂tazemetostat和valemetostat最近分别获批用于滤泡性淋巴瘤和成人T细胞白血病/淋巴瘤的临床治疗。在滤泡性淋巴瘤中,AID的表达导致突变特征增加和基因组不稳定性。由于EZH2抑制剂在正常和淋巴瘤B细胞中诱导表观遗传和转录变化,我们研究了这些抑制剂是否会改变AID介导的染色体易位模式。在此我们显示,在CH12F3小鼠B细胞或MEC-1人B细胞中作为单药治疗时,EZH2抑制剂处理未显著改变AID表达或AID依赖性染色体易位频率。相反,当与增强AID表达的PI3Kδ抑制联合使用时,EZH2抑制显著增加了染色体
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL15520、9606。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE297736
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 19 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
EZH2组蛋白甲基转移酶抑制剂他泽司他(tazemetostat)和伐美司他(valemetostat)近期分别获批用于滤泡性淋巴瘤和成人T细胞白血病/淋巴瘤的临床治疗。在滤泡性淋巴瘤中,AID的表达是突变特征增加和基因组不稳定的原因。由于EZH2抑制剂可在正常B细胞和淋巴瘤B细胞中诱导表观遗传和转录改变,我们研究了这些抑制剂是否能改变AID介导的染色体易位模式。在此我们显示,在CH12F3小鼠B细胞或MEC-1人B细胞中作为单药治疗时,EZH2抑制剂处理并未显著改变AID表达或AID依赖性染色体易位频率。相反,当与增强AID表达的PI3Kδ抑制联合使用时,与单独抑制EZH2或PI3Kδ相比,EZH2抑制在小鼠CH12F3细胞和人MEC-1细胞中均显著增加了染色体易位的频率。在Ligase4缺陷的小鼠B细胞中,EZH2抑制还进一步增强了易位的形成。
在机制上,B细胞中EZH2的抑制会去除抑制性组蛋白修饰H3K27me3,同时增强活性组蛋白修饰H3K27ac,从而在高AID活性或Ligase4缺陷的情况下选择性增加转录活性并促进染色体易位形成。这些发现凸显了诱导表观遗传改变的药物对染色体易位的影响,并证明了EZH2抑制剂作为单药治疗的遗传安全性,同时强调当用于易发生易位的细胞(如AID水平高或DNA修复缺陷的B细胞)时,基因组不稳定性风险增加。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




