恶性疟原虫感染红细胞来源细胞外囊泡转移miR451a破坏中性粒细胞功能数据集

研究聚焦恶性疟原虫感染红细胞来源的细胞外囊泡向原代人类中性粒细胞转移宿主 microRNA miR451a,并评估其对中性粒细胞转录及效应功能(ROS 产生、群集运动和抗菌活性)的影响

geo
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基因组分类GPL342849606
GSE296044: Extracellular vesicles derived from Plasmodium falciparum-infected red blood cells transfer miR451a, disrupting neutrophil function and contributing to immune dysregulation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

恶性疟原虫感染红细胞来源细胞外囊泡转移miR451a破坏中性粒细胞功能数据集

Extracellular vesicles derived from Plasmodium falciparum-infected red blood cells transfer miR451a, disrupting neutrophil function and contributing to immune dysregulation

该数据集来自 NCBI GEO(GSE296044),包含 1 个文件(GSE296044_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序表达谱,物种为人类(9606),平台为 GPL34284。研究聚焦恶性疟原虫感染红细胞来源的细胞外囊泡向原代人类中性粒细胞转移宿主 microRNA miR451a,并评估其对中性粒细胞转录及效应功能(ROS 产生、群集运动和抗菌活性)的影响。数据可用于分析 miR451a 介导的中性粒细胞功能抑制与免疫失调相关表达变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):由恶性疟原虫引起的疟疾会损害先天免疫,但其潜在机制仍知之甚少。在此,我们证明疟原虫利用感染红细胞来源的细胞外囊泡(iRBC-EVs)作为机制,将宿主 microRNA miR451a 转移至原代人类中性粒细胞,有效抑制其免疫功能。使用原代人类中性粒细胞和用含有 miR451a 的慢病毒表达载体转导的人白血病细胞(HL-60 细胞)(HL-60miR451a),我们评估了 miR451a 对中性粒细胞转录和效应功能(ROS 产生、群集运动和抗菌活性)的影响。微流控实验表明,当随后用白色念珠菌攻击时,转移的 miR451a 显著降低了原代人类中性粒细胞和 HL-60miR451a 的趋化性和群集运动能力。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296044

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 05 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE296044

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疟疾由恶性疟原虫引起,可损害固有免疫,但其潜在机制仍知之甚少。在此,我们证明疟原虫利用源自感染红细胞的细胞外囊泡(iRBC-EVs)作为一种机制,将宿主microRNA miR451a转移至原代人中性粒细胞,从而有效抑制其免疫功能。我们使用原代人中性粒细胞以及转导了含miR451a慢病毒表达载体的人白血病细胞(HL-60细胞)(HL-60miR451a),评估了miR451a对中性粒细胞转录及效应功能(ROS产生、成群运动和抗菌活性)的影响。微流控实验显示,当随后用白色念珠菌攻击时,转移的miR451a显著降低了原代人中性粒细胞和HL-60miR451a的趋化性和成群运动能力。批量及单细胞转录组分析揭示,miR451a改变了原代中性粒细胞和HL-60miR451a的转录调控,进一步损害其免疫应答。

此外,我们证明,被吞噬的iRBC-EVs会抑制活性氧(ROS)的产生,并在受到鼠伤寒沙门菌攻击时降低中性粒细胞的抗微生物杀伤活性。这些观察到的免疫抑制机制为疟疾感染者对侵袭性细菌或真菌疾病易感性增加的机制提供了关键见解。我们的发现揭示了恶性疟原虫与宿主免疫系统之间的分子相互作用,突出了疟疾诱导的免疫抑制如何通过损害中性粒细胞功能而加剧对严重细菌感染的易感性。这一认识对于旨在减轻疟疾流行地区合并感染和脓毒症的治疗策略具有重要意义。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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