MBL向CLL转化单细胞图谱 [MBL_CLL_GEO_DataSet3]

该数据集来自 NCBI GEO,聚焦单克隆B细胞增多症(MBL)向慢性淋巴细胞白血病(CLL)转化的单细胞研究。数据包含低计数和高计数MBL及CLL血液样本的单细胞RNA与ATAC测序,用于追踪从生理性B细胞到CLL的连续变化

geo
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基因组分类GPL246769606
GSE295491: Single cell landscape of MBL/CLL transition [MBL_CLL_GEO_DataSet3]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

MBL向CLL转化单细胞图谱 [MBL_CLL_GEO_DataSet3]

GSE295491 数据集聚焦于单克隆B细胞增多症(MBL)向慢性淋巴细胞白血病(CLL)转化的单细胞研究,来源于 NCBI GEO 数据库,归类为肿瘤/白血病方向。该数据集通过单细胞 RNA 与 ATAC 测序技术,对低计数(LC)和高计数(HC)MBL 以及 CLL 血液样本进行分析,旨在追踪从生理性 B 细胞到 CLL 的连续变化过程。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE295491_series_matrix.txt.gz,由作者 Livius 和 Penter 发布,发布时间为 Apr 24 202。该数据集为研究 MBL 向 CLL 转化的表观遗传与转录水平变化提供了单细胞层面的数据资源。

【数据集背景】

单克隆B细胞增多症(MBL)向慢性淋巴细胞白血病(CLL)的转化过程,在表观遗传和转录水平上仍缺乏明确的界定。该数据集正是针对这一研究空白而构建,通过单细胞 RNA 和 ATAC 测序技术,对低计数(LC)和高计数(HC)MBL 以及 CLL 血液样本进行测序分析,以追踪从生理性 B 细胞到 CLL 的连续变化。该数据集所属分类为肿瘤/白血病,主题涉及高通量测序的表达谱分析,物种标签为 9606(人类),平台标签为 GPL24676。

【数据内容】

该数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE295491_series_matrix.txt.gz,文件格式为 GZIP 压缩包。数据内容涵盖低计数和高计数 MBL 及 CLL 血液样本的单细胞 RNA 与 ATAC 测序结果,用于刻画从生理性 B 细胞向 CLL 演进的连续状态。源站标题为“Single cell landscape of MBL/CLL transition [MBL_CLL_GEO_DataSet3]”,数据集英文名为 GSE295491: Single cell landscape of MBL/CLL transition [MBL_CLL_GEO_DataSet3]。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),作者为 Livius 和 Penter,发布时间为 Apr 24 202。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676 和 9606。源站描述指出,研究对低计数(LC)和高计数(HC)MBL 及 CLL 血液样本进行了单细胞 RNA 和 ATAC 测序,以追踪从生理性 B 细胞到 CLL 的连续变化。

【适用场景】

该数据集适用于研究单克隆B细胞增多症(MBL)向慢性淋巴细胞白血病(CLL)转化过程中的表观遗传与转录水平变化,可用于追踪从生理性 B 细胞到 CLL 的连续演变。其单细胞 RNA 与 ATAC 测序数据可用于表达谱分析等高通量测序研究场景。具体分析方向源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可下载数据文件 GSE295491_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295491

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单克隆B细胞增多症(MBL)向慢性淋巴细胞白血病(CLL)的转变在表观遗传和转录水平上仍不明确。在此,我们对低计数(LC)和高计数(HC)MBL及CLL血液样本进行了单细胞RNA和ATAC测序,以追踪从生理性B细胞到CLL的连续演变过程。

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