Rps15突变通过翻译重编程、氧化应激和基因组不稳定驱动B细胞恶性肿瘤

该数据集来自NCBI GEO,包含一个高通量测序表达谱数据文件,围绕热点Rps15-S138F突变在体内模型中驱动B细胞恶性肿瘤的机制展开

geo
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基因组分类GPL1905710090
GSE293841: Rps15 mutation drives B cell malignancy through translational rewiring, oxidative stress and genomic instability

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

Rps15突变通过翻译重编程、氧化应激和基因组不稳定驱动B细胞恶性肿瘤

Rps15 mutation drives B cell malignancy through translational rewiring, oxidative stress and genomic instability

该数据集来自NCBI GEO,包含一个高通量测序表达谱数据文件,围绕热点Rps15-S138F突变在体内模型中驱动B细胞恶性肿瘤的机制展开。数据覆盖白血病前状态及老年突变小鼠最终发生的B细胞白血病,涉及翻译重编程、氧化应激、DNA损伤和p53依赖反应等过程。可用于分析Rps15突变相关的基因表达变化、白血病发生机制及潜在分子标志物研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 04 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):核糖体蛋白突变日益被认为与癌症风险相关,并被认为会扰乱核糖体功能。同时,据报道它们会激活p53这一关键抗癌屏障。为确定这些突变如何克服这一保护性阻滞以实现肿瘤发生,我们构建了热点Rps15-S138F突变的体内模型,该突变被认为是慢性淋巴细胞白血病的推定驱动因素。在白血病前状态下,该突变诱导蛋白质不稳定性、核糖体生物发生缺陷和翻译改变,导致氧化应激、DNA损伤和p53依赖反应的诱导,从而促进初始细胞低增殖。然而,携带突变Rps15的老年小鼠最终发生B细胞白血病(37%外显率),表现出增加的Myc活性以及强烈的促生存和增殖特征。因此,突变Rps15既诱导低增殖又……

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL19057、10090。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE293841

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 06 202,引用时请注意版本时效。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

核糖体蛋白突变与癌症风险的关联日益受到关注,并被认为会扰乱核糖体功能。与此同时,据报道这些突变会激活p53——一个关键的抗癌屏障。为确定这些突变如何克服这一保护性障碍以促成肿瘤发生,我们构建了热点Rps15-S138F突变的体内模型,该突变已被鉴定为慢性淋巴细胞白血病的推定驱动因素。在白血病前期状态下,该突变诱导蛋白质不稳定性、核糖体生物合成缺陷及翻译改变,导致氧化应激、DNA损伤以及p53依赖性应答的诱导,从而促进初始细胞低增殖。然而,携带Rps15突变的老龄小鼠最终发展为B细胞白血病(外显率37%),表现出Myc活性增强以及强烈的促生存和增殖特征。

因此,突变型Rps15同时诱导低增殖和高增殖信号,最初偏向于细胞周期阻滞;并且通过翻译重编程,氧化应激、DNA损伤应答缺陷和基因组不稳定性为获得额外的驱动突变(如TP53缺失)创造了条件,这些突变能够克服这种细胞周期阻滞,从而触发肿瘤发生。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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