IRF1激活及靶基因诱导驱动全反式维甲酸在急性早幼粒细胞白血病中的疗效并可能作为癌症治疗预测指标

源站描述显示,研究通过时间序列转录组分析识别全反式维甲酸(ATRA)早期转录响应中的关键调控因子,并结合ChIP-seq和功能实验评估IRF1的作用,以探究ATRA抗肿瘤作用的分子基础

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时间序列预测GPL167919606
GSE292653: IRF1 activation and target gene induction drive all-trans retinoic acid efficacy in acute promyelocytic leukemia with potential as a predictive indicator for cancer treatment

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

IRF1激活及靶基因诱导驱动全反式维甲酸在急性早幼粒细胞白血病中的疗效并可能作为癌症治疗预测指标

IRF1 activation and target gene induction drive all-trans retinoic acid efficacy in acute promyelocytic leukemia with potential as a predictive indicator for cancer treatment

该数据集来自NCBI,包含1个文件(GSE292653_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/白血病。源站描述显示,研究通过时间序列转录组分析识别全反式维甲酸(ATRA)早期转录响应中的关键调控因子,并结合ChIP-seq和功能实验评估IRF1的作用,以探究ATRA抗肿瘤作用的分子基础。数据可用于研究ATRA在急性早幼粒细胞白血病中的疗效机制及作为癌症治疗预测指标的潜力(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 22 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):全反式维甲酸(ATRA)在多种癌症中展现出显著的治疗潜力,最突出的是通过促进分化成功治疗急性早幼粒细胞白血病(APL)。除分化外,ATRA还能在造血和非造血恶性肿瘤中诱导细胞周期阻滞、生长抑制和免疫调节。尽管具有这些多方面效应,驱动ATRA疗效的机制仍不完全清楚,这阻碍了其应用于其他癌症。为了研究ATRA抗肿瘤作用的分子基础,我们进行了详细的时间序列转录组分析,以识别参与ATRA早期转录响应的关键调控因子。此外,染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)和功能实验评估了关键调控因子IRF1的作用,以确定它如何驱动ATRA

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE292653

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE292653

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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

全反式维甲酸(ATRA)在多种癌症中展现出显著的治疗潜力,最突出的是其通过促进分化成功治疗急性早幼粒细胞白血病(APL)。除诱导分化外,ATRA还能在造血性和非造血性恶性肿瘤中诱导细胞周期阻滞、生长抑制和免疫调节。尽管具有这些多方面的作用,驱动ATRA疗效的机制仍未被完全阐明,这阻碍了其应用于其他癌症。为探究ATRA抗肿瘤作用的分子基础,我们进行了详细的时间序列转录组分析,以鉴定参与ATRA早期转录反应的关键调控因子。此外,通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)和功能实验评估了关键调控因子IRF1的作用,以确定其如何驱动ATRA的疗效。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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