B细胞中分级组成型NF-κB信号驱动SLL/CLL样淋巴瘤发生并克服微环境依赖
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE289013_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/白血病,采用高通量测序进行表达谱分析

基本信息
资源简介
B细胞中分级组成型NF-κB信号驱动SLL/CLL样淋巴瘤发生并克服微环境依赖
Graded constitutive NF-κB signaling in B cells drives SLL/CLL-like lymphomagenesis and overcomes microenvironment dependence
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE289013_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/白血病,采用高通量测序进行表达谱分析。研究在小鼠B细胞中通过表达一个或两个拷贝的组成型活性IKK2变体(IKK2ca)诱导分级经典NF-κB激活,发现强NF-κB信号驱动B1a细胞早期扩增并导致完全外显的致死性淋巴瘤发生,这些B细胞恶性肿瘤在病程、基因表达和定型B细胞受体克隆性方面类似人类小淋巴细胞淋巴瘤(SLL)和慢性淋巴细胞白血病(CLL)。数据可用于研究NF-κB信号分级与淋巴瘤发生及微环境依赖的关系(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 07 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):NF-κB转录因子的异常激活是人类淋巴瘤的标志。许多淋巴瘤以及微环境相关的改变介导增强的NF-κB信号,这些改变发生在IκB激酶复合物及其关键激酶IKK2的上游,因此影响其他通路。在此,我们专门研究了小鼠B细胞中分级经典NF-κB激活的效应,该激活通过表达一个或两个拷贝的组成型活性IKK2变体(IKK2ca)诱导。强经典NF-κB信号驱动B1a细胞的早期扩增,最终导致完全外显的致死性淋巴瘤发生。这些B细胞恶性肿瘤在病程、基因表达和定型B细胞受体克隆性方面类似人类小淋巴细胞淋巴瘤(SLL)和慢性淋巴细胞白血病(CLL)。经典NF-κB激活较弱的小鼠呈现
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL19057、10090。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE289013
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 11 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
NF-κB转录因子的异常激活是人类淋巴瘤的标志性特征。许多介导NF-κB信号增强的淋巴瘤相关及微环境相关改变发生于IκB激酶复合物及其关键激酶IKK2的上游,因此影响其他通路。本研究通过表达一个或两个拷贝的组成性激活IKK2变体(IKK2ca)诱导小鼠B细胞中不同程度的经典NF-κB激活,并专门研究了其效应。强经典NF-κB信号驱动B1a细胞的早期扩增,最终导致完全外显的致死性淋巴瘤发生。这些B细胞恶性肿瘤在疾病进程、基因表达和定型性B细胞受体克隆性方面类似于人类小淋巴细胞淋巴瘤(SLL)和慢性淋巴细胞白血病(CLL)。经典NF-κB激活程度较低的小鼠表现为延迟、更异质的淋巴瘤发生且外显率较低,突显了NF-κB的剂量依赖性效应。
在机制上,我们证明组成型IKK2信号为B1a细胞提供了深刻的细胞内在竞争优势,并与TCL1过表达强烈协同作用,导致严重加速和加重的CLL样疾病。此外,强烈的组成型NF-κB激活克服了TC1tg淋巴瘤细胞对必需环境维持信号的 critical 依赖性。总之,我们在动物模型中提供了直接体内证据,证明经典NF-κB信号作为致癌驱动因素,并证明肿瘤微环境依赖性降低是淋巴瘤发生中NF-κB介导的关键机制。我们的发现强调了该通路在人类SLL/CLL中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力,特别是对于侵袭性/难治性疾病。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




