GSE28654：ARSD表达与慢性淋巴细胞白血病IgVH突变状态、ZAP-70及疾病进展相关

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE28654

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数据说明

多项研究证实，IgVH突变状态和ZAP-70表达是CLL中最相关的预后标志物，提示可将患者分为两个亚组：预后良好组（MTZAP-70-）和预后不良组（UMZAP-70+）。我们测定了112例CLL患者B细胞的基因表达，将其分为三组：第一组为IgVHMT且ZAP-70-，第二组为IgVHUM且ZAP-70+，第三组包括IgVHUM ZAP-70-和IgVHMT ZAP-70+。我们发现，编码参与脂质（甘油酯/甘油磷脂）代谢酶的LPL、AGPAT2、MBOAT1、CHPT1、AGPAT4、PLD1基因在UMZAP-70+中过表达。此外，本研究表明，属于鞘脂代谢的ARSD基因是一个新的基因，相较于MTZAP-70-，其在UMZAP-70+中显著过表达。通过Western blotting检测发现，与MTZAP-70- CLL B细胞及健康个体B细胞相比，ARSD蛋白在UMZAP-70+中的浓度显著更高。

统计分析显示，ARSD与IgVH突变状态之间存在强相关性；ARSD蛋白水平与CLL患者需要治疗相关，且在此用途上与IgVH突变状态相当。我们的研究突显了ARSD作为CLL中有前景的新预后因素，以及鞘脂代谢作为CLL中可能的新生物学机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。