组蛋白伴侣ASF1B在胎儿与成人红系造血中调控组蛋白变体H3.3的II期研究

该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-seq表达谱矩阵文件,覆盖小鼠红白血病MEL细胞、人脐带来源红系祖细胞HUDEP2及人CD34+红系祖细胞

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基因组分类GPL342819606
GSE285838: Histone chaperon ASF1B recruits distinct epigenetic factors in regulation of histone variant H3.3 during the fetal and adult erythropoiesis II

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

组蛋白伴侣ASF1B在胎儿与成人红系造血中调控组蛋白变体H3.3的II期研究

Histone chaperon ASF1B recruits distinct epigenetic factors in regulation of histone variant H3.3 during the fetal and adult erythropoiesis II

该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-seq表达谱矩阵文件,覆盖小鼠红白血病MEL细胞、人脐带来源红系祖细胞HUDEP2及人CD34+红系祖细胞。研究通过敲低ASF1A、ASF1B和HIRA并联合或不联合DMSO诱导,观察红系分化相关基因表达变化,发现ASF1A/ASF1B/HIRA缺失显著降低红系分化相关基因表达。数据可用于红系造血调控机制及白血病相关表达谱分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 03 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):为深入了解ASF1A、ASF1B和HIRA在红系造血过程中的功能,在小鼠红白血病(MEL)细胞、人脐带来源祖红系2(HUDEP2)细胞和人CD34+红系祖细胞中进行了RNA-seq。值得注意的是,在有/无DMSO诱导的情况下敲低ASF1A、ASF1B和HIRA均显著降低了与红系分化相关基因的表达。同时,在HUDEP2细胞中敲低ASF1A和ASF1B以及在CD34+细胞中敲低ASF1B均显著降低了与红系分化相关基因的表达。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34281、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285838

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 16 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为深入了解ASF1A、ASF1B和HIRA在红细胞生成过程中的功能,我们在小鼠红白血病(MEL)细胞、人脐带来源的祖红细胞2(HUDEP2)细胞和人CD34+红系祖细胞中进行了RNA-seq。值得注意的是,在有/无DMSO诱导的情况下,敲低ASF1A、ASF1B和HIRA均显著降低了与红系分化相关基因的表达。同时,在HUDEP2细胞中敲低ASF1A和ASF1B,以及在CD34+细胞中敲低ASF1B,均显著降低了与红系分化相关基因的表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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