AML诱导TTCR-C4 NK样转录偏移与低持久性和功能障碍

该数据集来自NCBI GEO,包含单细胞RNA测序(scRNA-seq)和bulk RNA测序(bulk RNA-seq)数据,用于研究急性髓系白血病(AML)背景下及WT1特异性TCR-T细胞治疗中的T细胞应答

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基因组分类GPL167919606
GSE285214: AML induces TTCR-C4 NK-like transcriptional  skewing associated with low persistence and dysfunction

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

AML诱导TTCR-C4 NK样转录偏移与低持久性和功能障碍

AML induces TTCR-C4 NK-like transcriptional skewing associated with low persistence and dysfunction

该数据集来自NCBI GEO,包含单细胞RNA测序(scRNA-seq)和bulk RNA测序(bulk RNA-seq)数据,用于研究急性髓系白血病(AML)背景下及WT1特异性TCR-T细胞治疗中的T细胞应答。数据聚焦AML诱导的TTCR-C4 NK样转录偏移,及其与低持久性和功能障碍的关联。文件数量为1,样例文件为GSE285214_series_matrix.txt.gz。可用于探索AML微环境对T细胞状态的影响、TCR-T治疗响应机制及潜在生物标志物分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 23 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含单细胞RNA测序(scRNA-seq)和bulk RNA测序(bulk RNA-seq)数据,用于研究急性髓系白血病(AML)和WT1特异性TCR-T细胞治疗背景下的T细胞应答。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285214

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 17 202,引用时请注意版本时效。

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数据说明

该数据集包括为研究急性髓系白血病(AML)和WT1特异性TCR-T细胞治疗背景下的T细胞反应而生成的单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据。scRNA-seq数据集包含接受WT1特异性TCR工程T细胞(TCR-T)治疗的AML患者的外周血(PB)和骨髓(BM)样本。我们特别分析了内源性CD8⁺ T细胞和TCR-T细胞,以表征其转录状态并评估AML对T细胞分化和功能的影响。对一名具有持久临床反应的患者样本进行深入分析,为了解TCR-T细胞随时间变化的转录谱提供了见解,包括阿扎胞苷治疗后的情况。批量RNA-seq数据集是使用AML诱导T细胞功能障碍的体外模型生成的。识别HLA-A0201限制性WT137-45表位的CD8⁺转基因WT1特异性T细胞(TTCR37-45)被反复暴露于表达WT1的HLA-A0201转导的K562 AML细胞。

第13天肿瘤控制丧失与转录状态从初始/干细胞样状态向富集效应、活化/耗竭及NK样/Temra基因特征的转变相关。至第23天,活化/耗竭标志物下降,而NK样/Temra相关基因持续存在或增加,突显了功能失调T细胞的表型转变。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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