慢性淋巴细胞白血病患者B细胞转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE273421

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CD22（也称为Siglec-2）属于识别聚糖的Siglec家族蛋白，负向调节B细胞受体介导的信号传导。在慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者的B细胞中，CD22表达下调。然而，调控CD22转录的具体机制尚未完全明了。本研究确定了人类CD22基因的最小启动子，并通过蛋白质组学分析鉴定了与CD22启动子结合的转录因子。利用这份转录组数据集（来自6例CLL患者外周血B细胞的RNAseq），我们（1）验证了CD22转录本表达水平（通过RNAseq评估）与CD22蛋白表达水平（通过流式细胞术评估）之间的正相关性，以及（2）检验了CD22转录本表达水平与结合于最小CD22启动子的转录因子表达水平之间的相关性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。