HLF缺失通过细胞-胶原相互作用促进实体瘤转移

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272563

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转移是癌症相关死亡的主要原因，但其潜在机制仍不明确。我们利用透明细胞肾细胞癌（ccRCC）——一种常发生肺转移的肿瘤类型——进行了体内全基因组CRISPR-Cas9筛选，并鉴定出HLF是肺转移的有效抑制因子。虽然已知HLF易位是白血病中的致癌事件，但其在实体癌中的作用仍不清楚。我们的研究揭示，HLF缺失增强了ccRCC的迁移和肺转移，而HLF过表达则消除了这些效应。这一发现扩展至多种实体瘤类型。在ccRCC患者中，HLF表达在转移部位降低，并与表观遗传沉默相关。HLF水平与胶原中的迁移潜能呈负相关。在机制上，HLF调控leupaxin表达，通过paxillin影响胶原硬度与肌动蛋白细胞骨架的整合，从而抑制癌细胞迁移和肺转移。这些数据表明，HLF通过实体瘤中的细胞-胶原相互作用影响肺转移。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。