AKAP95凝聚体调控转录并可作为MLL融合驱动肿瘤发生的靶点（PRO-Seq）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271856

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

致癌性转录是MLL重排（MLLr）白血病中的一个关键事件，然而转录共激活因子在MLL融合蛋白相关转录中的确切作用及其对白血病发生的贡献仍不完全清楚。在此，我们证明AKAP95在MLLr患者和MLL-AF9转化的小鼠骨髓中均显著上调。AKAP95被证明对小鼠MLL-AF9白血病的起始至关重要，其在全基因组范围内广泛结合DNA，尤其是在基因启动子区域。与易位的MLL1片段的相互作用主要通过相分离机制发生。AKAP95的RNA结合特性及其相分离行为决定了其与前体mRNA的结合以及同时发生的转录调控。重要的是，我们设计了一种肽来破坏其相分离，有效减弱了AKAP95介导的转录共激活并抑制了MLLr细胞系的生长。这些发现展示了一个RNA结合蛋白通过相分离协调转录和肿瘤发生的生动实例，凸显了靶向致癌性凝聚机制进行治疗的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。