ETS1 招募 cBAF 劫持 T 细胞白血病中造血干细胞 MYB 增强子 [数据集 2]

数据通过高通量测序进行基因组结合/占据谱分析,平台为 GPL24676,物种为 9606。源站描述指出 Notch 信号是 T-ALL 中最常见的致癌通路,但泛 Notch 抑制剂存在剂量限制毒性,研究因此转向 ETS1,并鉴定出 MYB +140kb 处被 Notch 结合的 ETS

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时间序列GPL246769606
GSE263913: ETS1 recruits cBAF to hijack the hematopoietic stem cell MYB enhancer in T-cell leukemia [dataset 2]

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

ETS1 招募 cBAF 劫持 T 细胞白血病中造血干细胞 MYB 增强子 [数据集 2]

ETS1 recruits cBAF to hijack the hematopoietic stem cell MYB enhancer in T-cell leukemia [dataset 2]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 ETS1 recruits cBAF to hijack the hematopoietic stem cell MYB enhancer in T-cell leukemia [dataset 2],属于肿瘤/白血病方向。数据通过高通量测序进行基因组结合/占据谱分析,平台为 GPL24676,物种为 9606。文件数量为 1,样例文件为 GSE263913_series_matrix.txt.gz。源站描述指出 Notch 信号是 T-ALL 中最常见的致癌通路,但泛 Notch 抑制剂存在剂量限制毒性,研究因此转向 ETS1,并鉴定出 MYB +140kb 处被 Notch 结合的 ETS。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 13 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Notch 信号是 T-ALL 中最常见的致癌通路,但临床试验显示泛 Notch 抑制剂会导致剂量限制性毒性。因此,我们将重点从 Notch 转向 ETS1,ETS1 是在 T-ALL 背景下最常与 Notch 占据的调控元件共结合的核心转录因子之一。一个最重要的 ETS1 依赖性元件是 MYB +140kb 处被 Notch 结合的增强子,我们将其命名为 ETS-MYB 增强子(E-Me)。利用基因工程小鼠模型和染色质谱分析,我们表明 E-Me 选择性促进造血干细胞的自我更新,在定向 T 细胞祖细胞中失活;并重新激活以促进 Notch 诱导的转化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263913

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 31 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263913

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Notch信号通路是T-ALL中最常见的致癌途径,但临床试验显示,泛Notch抑制剂会导致剂量限制性毒性。因此,我们将焦点从Notch转向ETS1,ETS1是在T-ALL背景下最常与Notch占据的调控元件共同结合的顶级转录因子之一。一个最重要的ETS1依赖性元件是位于MYB +140kb处的Notch结合增强子,我们将其命名为ETS-MYB增强子(E-Me)。利用基因工程小鼠模型和染色质 profiling,我们发现E-Me选择性促进造血干细胞的自我更新,在定向T细胞祖细胞中失活;并在Notch诱导的转化中被重新激活以促进转化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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