MBNL1劫持结构化单链远端DNA元件维持KMT2A重排白血病FLT3表达
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE263684,聚焦KMT2A重排白血病中MBNL1通过识别FLT3增强子内富含连续鸟嘌呤的结构化单链DNA元件来维持FLT3表达

基本信息
资源简介
MBNL1劫持结构化单链远端DNA元件维持KMT2A重排白血病FLT3表达
MBNL1 hijacks a structured single-stranded distal DNA element to sustain FLT3 expression in KMT2A-rearranged leukemias
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE263684,聚焦KMT2A重排白血病中MBNL1通过识别FLT3增强子内富含连续鸟嘌呤的结构化单链DNA元件来维持FLT3表达。数据包含1个文件,样例为GSE263684_series_matrix.txt.gz,属于Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing类型,平台为GPL24676,物种为9606。可用于研究MBNL1与FLT3增强子结合的基因组占据特征,探索KMT2A重排白血病中FLT3持续表达的调控机制,为相关治疗靶点发现提供数据支持(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 10 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):KMT2A重排(KMT2A-r)白血病维持致癌性FLT3表达的分子机制在很大程度上仍不清楚,限制了治疗机会。在此,我们通过DepMap数据集探索和组合CRISPR筛选,鉴定出RNA结合蛋白MBNL1是FLT3的新型正调控因子。MBNL1以KMT2A-r背景依赖的方式维持FLT3表达,从而促进白血病细胞存活。在机制上,我们发现MBNL1通过其锌指结构域和C端非结构化区域,识别FLT3增强子内一个含有五个连续鸟嘌呤的结构化单链DNA(ssDNA)元件。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE263684
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 10 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
KMT2A重排(KMT2A-r)白血病维持致癌性FLT3表达的分子机制在很大程度上仍不清楚,限制了治疗机会。在此,我们通过DepMap数据集探索和组合CRISPR筛选,鉴定出RNA结合蛋白MBNL1是FLT3的新型正调控因子。MBNL1以KMT2A-r背景依赖的方式维持FLT3表达,从而促进白血病细胞存活。在机制上,我们发现MBNL1通过其锌指结构域和C端非结构化区域,识别FLT3增强子内一个含有五个连续鸟嘌呤的结构化单链DNA(ssDNA)元件。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




