GSE255224：基于单核苷酸多态性与抗体的细胞分选（SNACS）用于单细胞DNA测序数据去多重化

资源简介

GSE255224：基于单核苷酸多态性与抗体的细胞分选（SNACS）用于单细胞DNA测序数据去多重化

Single Nucleotide Polymorphism (SNP) and Antibody-based Cell Sorting (SNACS): A tool for demultiplexing single-cell DNA sequencing data

该数据集来自NCBI GEO，标题为GSE255224，聚焦于单细胞DNA测序（scDNA-seq）及加入细胞表面抗体的多模态分析（scDAb-seq）在肿瘤异质性研究中的应用。针对大规模队列中多重实验成本高、scDNA-seq去多重化困难的问题，提出SNACS方法，结合患者水平的细胞表面标识与遗传多态性的自然变异，对scDNA-seq数据进行去多重化。数据集包含1个文件（GSE255224_series_matrix.txt.gz），作者为Vanessa E Kennedy，发布时间为2021年2月6日，主题标签涉及Other、GPL24676和9606，可用于肿瘤与白血病相关单细胞测序数据的去多重化研究（来源 NCBI）。

【数据集背景】

源站首次发布：Feb 06 202。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：动机 近年来，单细胞DNA测序（scDNA-seq）以及加入细胞表面抗体的多模态分析（scDAb-seq）为癌症异质性提供了关键见解。然而，在大型患者队列中扩展这些技术通常成本和时间上不可行。多重化，即将来自不同患者的细胞合并到单个实验中，提供了一种可能的解决方案。虽然多重化方法已可用于scRNAseq，但在scDNAseq中准确的去多重化仍是一个未满足的需求。结果 在此，我们介绍SNACS：单核苷酸多态性（SNP）与基于抗体的细胞分选。SNACS依赖于患者水平的细胞表面标识与遗传多态性的自然变异的组合，对scDNAseq数据进行去多重化。我们在一个由来自白血病患者的多样本实验组成的数据集上展示了SNACS的性能。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签：Other、GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE255224

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 10 202，引用时请注意版本时效。