GSE253457：RUNX1表达受超级增强子调控并是成人T细胞白血病/淋巴瘤的治疗靶点

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE253457

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

超级增强子（SEs）——即中介体复合物密集积累的基因组增强子区域——在调控肿瘤特异性基因表达中发挥重要作用，是肿瘤性疾病的潜在治疗靶点。含溴结构域蛋白4（BRD4）是结合于SE区域的蛋白复合物的组分之一。JQ1是已知的BRD4抑制剂之一，通过抑制SE介导的基因表达调控发挥抗肿瘤作用。成人T细胞白血病/淋巴瘤（ATL）对现有治疗高度耐药，预后极差。鉴于JQ1具有作为多种恶性肿瘤治疗药物的潜力，我们研究了JQ1的抗ATL作用。JQ1诱导细胞凋亡并抑制ATL细胞增殖。JQ1通过破坏SE介导的基因调控抑制RUNX1的表达，表明RUNX1可能是一个新的治疗靶分子。AI-10-104和Ro5-3335是分别为急性髓系白血病（AML）和淋巴细胞白血病（ALs）等血液系统恶性肿瘤开发的RUNX1抑制剂。

我们证明，这两种药物在有效浓度下能抑制携带RUNX1突变的ATL细胞系及患者样本中的细胞增殖，这些样本来源于急性淋巴细胞白血病(ALs)。同时，AI-10-104抑制了MYC原癌基因(c-MYC)的表达。RUNX1是ATL的一个潜在治疗靶点，它能促进c-MYC的表达。我们首次展示了在外周成熟T细胞血液恶性肿瘤——ATL中，RUNX1的表达是通过超级增强子(SEs)调控的。本研究表明，RUNX1可能是ATL的一个新型治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。