整合素缺失诱导T细胞急性淋巴细胞白血病在中枢神经系统蓄积

该数据集来自 NCBI GEO,聚焦 T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)向中枢神经系统(CNS)转移与蓄积的机制。研究构建了 Itgal-/-、Itgb1-/- 双敲除(DKO)小鼠 T-ALL 模型,并将其与野生型(WT)T-ALL 共转移,发现 DKO T-ALL 在 CNS 中蓄积数量为

geo
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基因组分类GPL2110310090
GSE244744: Loss of Integrins Induces T Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Accumulation in the Central Nervous System

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

整合素缺失诱导T细胞急性淋巴细胞白血病在中枢神经系统蓄积

Loss of Integrins Induces T Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Accumulation in the Central Nervous System

该数据集来自 NCBI GEO,聚焦 T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)向中枢神经系统(CNS)转移与蓄积的机制。研究构建了 Itgal-/-、Itgb1-/- 双敲除(DKO)小鼠 T-ALL 模型,并将其与野生型(WT)T-ALL 共转移,发现 DKO T-ALL 在 CNS 中蓄积数量为 WT 的十倍。数据包含 1 个文件,为 Crispr 来源的 DKO 与 WT T-ALL 细胞系在 CNS 和脾脏中的转录组表达谱,可用于比较两组细胞的基因表达差异,探索 T-ALL 在中枢神经系统蓄积的潜在分子机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 05 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)是一种常见的儿童癌症,以其侵袭性和早期向中枢神经系统(CNS)转移而闻名。尽管人们对 T-ALL 如何进入并在 CNS 内持续存在知之甚少,但我们假设,正常 T 细胞进入 CNS 所必需的两种整合素——LFA-1 和 VLA-4——也是 T-ALL 进入 CNS 所必需的,并开发了一种 DKO(Itgal-/-、Itgb1-/-)小鼠 T-ALL 模型来验证这一假设。然而,令我们非常惊讶的是,我们发现当 DKO T-ALL 与野生型(WT)T-ALL 共转移时,DKO T-ALL 不仅容易进入 CNS,而且实际上在那里蓄积的数量是 WT 的十倍。我们比较了来自 CNS 和脾脏的 Crispr 来源的 DKO 与 WT T-ALL 细胞系的转录谱,以探索是否能够识别出潜在的机制。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21103、10090。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244744

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 09 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)是一种常见的儿童癌症,以其侵袭性强和早期转移至中枢神经系统(CNS)而著称。尽管人们对T-ALL如何进入并在CNS内持续存在知之甚少,但我们假设两种整合素——LFA-1和VLA-4——是T-ALL进入CNS所必需的,这两种整合素是正常T细胞进入CNS的经典必要条件,并开发了一种DKO(Itgal-/-,Itgb1-/-)小鼠T-ALL模型来验证这一假设。然而,令我们大为惊讶的是,我们发现当DKO T-ALL与野生型(WT)T-ALL共转移时,DKO T-ALL不仅容易进入CNS,而且实际上在那里积累的数量是WT的十倍。我们比较了来自CNS和脾脏的Crispr衍生的DKO和WT T-ALL系的转录谱,以探索是否能够发现潜在的机制。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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