ZNF683标记抗PD-1治疗后Richter综合征中与抗肿瘤免疫相关的CD8+ T细胞群[CUT&RUN]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE241010

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

与其他许多血液系统恶性肿瘤不同，里氏综合征（Richter syndrome，RS）是一种起源于惰性慢性淋巴细胞白血病的侵袭性B细胞淋巴瘤，对PD-1阻断治疗有应答。为揭示应答的决定因素，我们分析了纵向采集自6例RS患者的17份骨髓样本的单细胞转录组数据。应答与中间型耗竭CD8效应/效应记忆T细胞相关，这类细胞以转录因子ZNF683高表达为标志，被确定由干细胞样记忆细胞演化而来，并不同于终末耗竭细胞。该特征与PD-1应答性实体瘤中肿瘤浸润细胞群体的特征存在重叠。研究发现ZNF683直接靶向关键T细胞基因（TCF7、LMO2、CD69），并影响T细胞细胞毒性与活化相关通路。对10例独立接受PD-1治疗的RS患者以及接受PD-1治疗的实体瘤患者治疗前外周血的分析，支持ZNF683高表达T细胞与应答之间的关联。针对组蛋白修饰H3K4me3、IgG同型（对照）和ZNF683（Hobit）的CUT&RUN测序开/关

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。