NF-κB诱导的T-bet表达抑制恶性B细胞增殖并与慢性淋巴细胞白血病良好预后相关

该数据集来自NCBI GEO,标题为NF-κB诱导的T-bet表达抑制恶性B细胞增殖并与慢性淋巴细胞白血病良好预后相关。数据可用于研究NF-κB信号通路、T-bet表达与慢性淋巴细胞白血病恶性B细胞增殖及预后之间的关联(来源 NCBI)

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时间序列预测GPL2424710090
GSE234226: NF-κB-induced expression of T-bet suppresses proliferation of malignant B cells and is associated with good prognosis in chronic lymphocytic leukemia

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

NF-κB诱导的T-bet表达抑制恶性B细胞增殖并与慢性淋巴细胞白血病良好预后相关

GSE234226 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries 数据集,主题为 NF-κB 诱导的 T-bet 表达抑制恶性 B 细胞增殖,并与慢性淋巴细胞白血病(CLL)的良好预后相关。该数据集属于肿瘤/白血病分类,由 Isabelle Seufert 提交,发布时间为 2024 年 6 月 6 日。数据集包含 1 个文件,即 GSE234226_series_matrix.txt.gz,采用高通量测序进行表达谱分析,平台编号为 GPL24247,物种编号为 10090。整体而言,该数据集可用于探索 NF-κB 信号通路、T-bet 表达与 CLL 恶性 B 细胞增殖及预后之间的关联。

【数据集背景】

慢性淋巴细胞白血病是一种以恶性 B 细胞积累为特征的血液肿瘤。该数据集所对应的研究聚焦于 NF-κB 信号通路诱导的 T-bet 表达,以及这一表达事件对恶性 B 细胞增殖的抑制作用,并将其与 CLL 患者的预后联系起来。数据集标题明确表达了这一生物学命题:NF-κB 诱导的 T-bet 表达抑制恶性 B 细胞的增殖,且与慢性淋巴细胞白血病良好预后相关。该数据集作为 SuperSeries 存在,源站描述指出它由下方列出的若干 SubSeries 组成,说明其设计上是对相关子系列数据的整合入口。

【数据内容】

该数据集以表达谱分析为核心内容,采用高通量测序技术获取转录层面的表达信息。数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE234226_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。主题标签中包含 GPL24247 平台标识和 10090 物种标识,表明数据基于特定芯片/测序平台并对应小鼠物种。除上述文件与平台、物种标识外,源站未提供更细的样本数量、分组设计或具体基因层面的内容说明。

【采集与来源】

数据集来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),由 Isabelle Seufert 提交,发布时间为 2024 年 6 月 6 日。源站将其归类于肿瘤/白血病方向,主题标签为高通量测序表达谱分析。作为 SuperSeries,其源站描述仅说明该系列由下方列出的 SubSeries 组成,未进一步展开各子系列的具体采集细节。样本处理、测序策略、建库方法等实验层面的信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究 NF-κB 信号通路与 T-bet 表达在慢性淋巴细胞白血病中的作用,特别是围绕恶性 B 细胞增殖抑制及预后关联的分析。研究者可将其用于表达谱层面的差异分析、通路相关基因表达模式探索,以及与其他 CLL 相关表达数据的比较研究。由于数据集以 SuperSeries 形式组织,也可作为进入相关 SubSeries 数据的入口,用于更细粒度的子研究。具体分析场景需结合数据实际内容确定,源站未提供针对特定分析流程的说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE234226_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取和解压。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认无误后再批量接入完整数据。由于该数据集为 SuperSeries,若需获取更细粒度的子系列数据,可依据源站列出的 SubSeries 进一步检索。源站未提供具体的读取脚本、分析参数或推荐工具。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,即系列矩阵文件,未提供原始测序数据或其他辅助文件的说明。源站描述较为简略,仅说明其为 SuperSeries 且由 SubSeries 组成,样本量、分组、重复数、测序深度等关键质量信息均未提供。主题标签中的物种标识为 10090(小鼠),与慢性淋巴细胞白血病的人类临床背景存在物种差异,使用时应予以注意。此外,发布时间在源站中记为“Jun 06 202”,年份信息不完整。整体而言,数据质量与适用边界需结合原始 SubSeries 及源站记录进一步核实。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Isabelle Seufert,来源站为 NCBI GEO。引用时应参照源站提供的对应文献或数据集记录。关于数据使用许可、再分发条件及引用格式的具体要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE234226

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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