NF-κB诱导的T-bet表达抑制恶性B细胞增殖并与慢性淋巴细胞白血病良好预后相关[scRNA-seq]

源站描述显示研究利用单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)和转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)分析 T-bet 在 TCL1 白血病中的调控作用

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE234225: NF-κB-induced expression of T-bet suppresses proliferation of malignant B cells and is associated with good prognosis in chronic lymphocytic leukemia [scRNA-seq]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

NF-κB诱导的T-bet表达抑制恶性B细胞增殖并与慢性淋巴细胞白血病良好预后相关[scRNA-seq]

NF-κB-induced expression of T-bet suppresses proliferation of malignant B cells and is associated with good prognosis in chronic lymphocytic leukemia [scRNA-seq]

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE234225,属于肿瘤/白血病分类,包含 1 个文件 GSE234225_series_matrix.txt.gz。源站描述显示研究利用单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)和转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)分析 T-bet 在 TCL1 白血病中的调控作用。数据可用于探索 T-bet 在恶性 B 细胞中的表达调控及其与慢性淋巴细胞白血病预后的关联(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 06 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):T-box转录因子T-bet由Tbx21编码,已被鉴定在B细胞的衰老和组织定位中发挥作用。在恶性B细胞中检测到T-bet表达,但其在B细胞恶性肿瘤中的潜在作用仍很大程度上未被探索。我们使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和使用测序的转座酶可及染色质测定(scATAC-seq)来分析T-bet在TCL1白血病中的调控作用。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE234225

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 25 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

T-box转录因子T-bet由Tbx21基因编码,已被发现参与B细胞的衰老和组织定位过程。在恶性B细胞中检测到了T-bet的表达,但其在B细胞恶性肿瘤中的潜在作用仍很大程度上未被探索。我们采用单细胞RNA测序(scRNA-seq)以及基于测序的转座酶可及染色质检测技术(scATAC-seq),来分析T-bet在TCL1白血病中的调控作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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