IDH突变急性髓系白血病的克隆与细胞结构解析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE230559

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

异柠檬酸脱氢酶1/2（IDH）突变是急性髓系白血病（AML）的早期启动事件。IDH突变型AML中复杂的克隆结构和细胞异质性是其临床表现和预后异质性的基础。通过整合单细胞基因分型和转录组学，我们展示了IDH突变型AML的干细胞样和炎症表型，并识别了与NPM1、NRAS和SRSF2共突变相关的克隆特异性程序。此外，这些克隆对IDH抑制剂联合化疗的治疗表现出不同的反应，包括消除、髓系分化的重建或在前体细胞群体中的保留。在IDH抑制剂单药治疗后的复发中，我们发现了干性、炎症、线粒体代谢和抗凋亡因子的上调，以及主要组织相容性复合体（MHC）II类抗原呈递的下调。在白血病前期阶段，我们观察到IDH2相关通路的上调，包括炎症。

我们提供了IDH突变型急性髓系白血病的详细表型分析，以及一个用于剖析诊断时和治疗后急性髓系白血病中反复突变基因贡献的框架，这对精准医疗具有重要意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。